RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g60130 View Network
Names	Os03g0815900 protein (Putative transcription elongation factor) (Transcription elongation factor S-II family protein, expressed)
Function	transcription elongation factor protein, putative, expressed
Attributes	Length: 368 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 41213.6 pI: 9.8491 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os03g60130.1 LOC_Os03g60130.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g54340 LOC_Os06g29080 LOC_Os04g31950 LOC_Os06g06510 LOC_Os04g25360 LOC_Os04g54330 LOC_Os06g09850 LOC_Os12g37590 LOC_Os11g05730 LOC_Os04g56800 LOC_Os05g38530 LOC_Os04g26841 LOC_Os04g48410 LOC_Os05g45420 LOC_Os11g40150 LOC_Os11g01450 LOC_Os09g34040 LOC_Os05g32430 LOC_Os05g01700 LOC_Os12g35030 LOC_Os06g38470 LOC_Os05g01020 LOC_Os05g05860 LOC_Os05g41210 LOC_Os07g48780 LOC_Os04g02820 LOC_Os05g27320 LOC_Os12g30060 LOC_Os10g30100 LOC_Os07g46660 LOC_Os10g34670 LOC_Os10g10990 LOC_Os07g49410 LOC_Os05g11980 LOC_Os09g32680 LOC_Os03g60130 LOC_Os05g38820 LOC_Os09g15320 LOC_Os07g43060 LOC_Os09g06560 LOC_Os07g32800 LOC_Os10g42950 LOC_Os04g42990 LOC_Os07g41180 LOC_Os05g46330 LOC_Os12g41400 LOC_Os11g20384 LOC_Os05g48030 LOC_Os06g06460 LOC_Os07g36940 LOC_Os08g39820 LOC_Os07g29420 LOC_Os10g28040 LOC_Os12g38970 LOC_Os12g37370 LOC_Os10g35250 LOC_Os12g39070 LOC_Os08g44770 LOC_Os05g05230 LOC_Os08g08040 LOC_Os07g44060 LOC_Os05g38710 LOC_Os05g02040 LOC_Os04g54940 LOC_Os09g02284 LOC_Os07g07610 LOC_Os05g36280 LOC_Os06g44030 LOC_Os05g41510 LOC_Os05g05260 LOC_Os07g08170 LOC_Os07g06980 LOC_Os04g46450 LOC_Os07g07240 LOC_Os09g30150 LOC_Os06g06090 LOC_Os04g56640 LOC_Os12g04180 LOC_Os02g39890 LOC_Os03g10990 LOC_Os03g16670 LOC_Os02g14860 LOC_Os01g11070 LOC_Os01g58240 LOC_Os02g04160 LOC_Os03g43890 LOC_Os02g52510 LOC_Os01g61810 LOC_Os02g05630 LOC_Os03g07080 LOC_Os01g16240 LOC_Os01g56550 LOC_Os03g17700 LOC_Os03g51550 LOC_Os01g56320 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g43020 LOC_Os02g29464 LOC_Os02g53230 LOC_Os03g16110 LOC_Os01g56980 LOC_Os02g10060 LOC_Os03g04950 LOC_Os01g74610 LOC_Os01g05420 LOC_Os03g53190 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g64690 LOC_Os03g60130 LOC_Os01g06010 LOC_Os01g15020 LOC_Os03g20370 LOC_Os01g32750 LOC_Os03g16860 LOC_Os03g53960 LOC_Os03g31300 LOC_Os02g06500 LOC_Os01g62230 LOC_Os02g04270 LOC_Os01g01312 LOC_Os01g16650 LOC_Os01g49290 LOC_Os01g64640 LOC_Os03g57760 LOC_Os01g69110 LOC_Os03g10780 LOC_Os02g19860 LOC_Os03g25260 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g22570 LOC_Os03g18080 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g59140 LOC_Os01g12880 LOC_Os01g73310 LOC_Os01g09460 LOC_Os03g47780

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g54340  LOC_Os06g29080  LOC_Os04g31950  LOC_Os06g06510  LOC_Os04g25360  LOC_Os04g54330
LOC_Os06g09850  LOC_Os12g37590  LOC_Os11g05730  LOC_Os04g56800  LOC_Os05g38530  LOC_Os04g26841
LOC_Os04g48410  LOC_Os05g45420  LOC_Os11g40150  LOC_Os11g01450  LOC_Os09g34040  LOC_Os05g32430
LOC_Os05g01700  LOC_Os12g35030  LOC_Os06g38470  LOC_Os05g01020  LOC_Os05g05860  LOC_Os05g41210
LOC_Os07g48780  LOC_Os04g02820  LOC_Os05g27320  LOC_Os12g30060  LOC_Os10g30100  LOC_Os07g46660
LOC_Os10g34670  LOC_Os10g10990  LOC_Os07g49410  LOC_Os05g11980  LOC_Os09g32680  LOC_Os03g60130
LOC_Os05g38820  LOC_Os09g15320  LOC_Os07g43060  LOC_Os09g06560  LOC_Os07g32800  LOC_Os10g42950
LOC_Os04g42990  LOC_Os07g41180  LOC_Os05g46330  LOC_Os12g41400  LOC_Os11g20384  LOC_Os05g48030
LOC_Os06g06460  LOC_Os07g36940  LOC_Os08g39820  LOC_Os07g29420  LOC_Os10g28040  LOC_Os12g38970
LOC_Os12g37370  LOC_Os10g35250  LOC_Os12g39070  LOC_Os08g44770  LOC_Os05g05230  LOC_Os08g08040
LOC_Os07g44060  LOC_Os05g38710  LOC_Os05g02040  LOC_Os04g54940  LOC_Os09g02284  LOC_Os07g07610
LOC_Os05g36280  LOC_Os06g44030  LOC_Os05g41510  LOC_Os05g05260  LOC_Os07g08170  LOC_Os07g06980
LOC_Os04g46450  LOC_Os07g07240  LOC_Os09g30150  LOC_Os06g06090  LOC_Os04g56640  LOC_Os12g04180
LOC_Os02g39890   LOC_Os03g10990   LOC_Os03g16670   LOC_Os02g14860   LOC_Os01g11070   LOC_Os01g58240
LOC_Os02g04160   LOC_Os03g43890   LOC_Os02g52510   LOC_Os01g61810   LOC_Os02g05630   LOC_Os03g07080
LOC_Os01g16240   LOC_Os01g56550   LOC_Os03g17700   LOC_Os03g51550   LOC_Os01g56320   LOC_Os02g30624
LOC_Os03g43020   LOC_Os02g29464   LOC_Os02g53230   LOC_Os03g16110   LOC_Os01g56980   LOC_Os02g10060
LOC_Os03g04950   LOC_Os01g74610   LOC_Os01g05420   LOC_Os03g53190   LOC_Os01g72790   LOC_Os01g64690
LOC_Os03g60130   LOC_Os01g06010   LOC_Os01g15020   LOC_Os03g20370   LOC_Os01g32750   LOC_Os03g16860
LOC_Os03g53960   LOC_Os03g31300   LOC_Os02g06500   LOC_Os01g62230   LOC_Os02g04270   LOC_Os01g01312
LOC_Os01g16650   LOC_Os01g49290   LOC_Os01g64640   LOC_Os03g57760   LOC_Os01g69110   LOC_Os03g10780
LOC_Os02g19860   LOC_Os03g25260   LOC_Os03g23909   LOC_Os03g22570   LOC_Os03g18080   LOC_Os01g05970
LOC_Os01g59140   LOC_Os01g12880   LOC_Os01g73310   LOC_Os01g09460   LOC_Os03g47780

Database Links
UniprotKB	Q84TW3
Ensembl	LOC_Os03g60130.1 LOC_Os03g60130.2
Refseq	NP_001051687.1
EMBL	AC133007 DP000009 AP008209 CM000140
KEGG	osa:4334559 dosa:Os03t0815900-01