RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g54340 View Network
Names	OSJNBa0043L09.28 protein (Os04g0635900 protein)
Function	double-strand break repair protein MRE11, putative, expressed
Attributes	Length: 706 Status: Complete Existence: Inferred from homology Molecular Weight: 79125.8 pI: 6.3088 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os04g54340.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g56730 LOC_Os10g41520 LOC_Os08g23680 LOC_Os05g14550 LOC_Os11g04880 LOC_Os05g48030 LOC_Os08g02690 LOC_Os07g08729 LOC_Os10g32030 LOC_Os05g11980 LOC_Os04g55040 LOC_Os11g40150 LOC_Os11g04954 LOC_Os11g44910 LOC_Os04g54340 LOC_Os06g38470 LOC_Os08g01680 LOC_Os11g48090 LOC_Os09g06560 LOC_Os12g40830 LOC_Os08g05840 LOC_Os05g43610 LOC_Os10g41450 LOC_Os07g01870 LOC_Os08g39140 LOC_Os06g08790 LOC_Os10g40590 LOC_Os10g11620 LOC_Os07g07240 LOC_Os11g08330 LOC_Os04g54940 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g34750 LOC_Os10g10730 LOC_Os06g50910 LOC_Os12g03190 LOC_Os05g45420 LOC_Os05g38810 LOC_Os07g10350 LOC_Os11g05570 LOC_Os09g26760 LOC_Os05g19270 LOC_Os07g46660 LOC_Os08g09320 LOC_Os05g08810 LOC_Os06g14190 LOC_Os07g30980 LOC_Os07g03160 LOC_Os12g04924 LOC_Os08g44770 LOC_Os07g32480 LOC_Os10g35580 LOC_Os09g27060 LOC_Os05g37390 LOC_Os06g09330 LOC_Os07g05960 LOC_Os09g24220 LOC_Os05g01020 LOC_Os07g49150 LOC_Os07g25420 LOC_Os07g06610 LOC_Os05g22260 LOC_Os08g08040 LOC_Os08g18110 LOC_Os05g46270 LOC_Os10g34580 LOC_Os06g38930 LOC_Os05g05260 LOC_Os06g08290 LOC_Os09g21770 LOC_Os06g29790 LOC_Os06g10600 LOC_Os10g37490 LOC_Os07g43360 LOC_Os10g10990 LOC_Os11g36390 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g49480 LOC_Os03g60130 LOC_Os02g39840 LOC_Os04g35420 LOC_Os04g39040 LOC_Os01g71960 LOC_Os04g49860 LOC_Os01g48210 LOC_Os02g30800 LOC_Os01g56550 LOC_Os01g01312 LOC_Os01g57460 LOC_Os04g54340 LOC_Os01g01960 LOC_Os02g56130 LOC_Os02g55340 LOC_Os04g45930 LOC_Os02g10060 LOC_Os02g32570 LOC_Os04g51700 LOC_Os02g11830 LOC_Os04g54330 LOC_Os01g73310 LOC_Os01g56940 LOC_Os03g13850 LOC_Os04g52900 LOC_Os04g36810 LOC_Os02g45820 LOC_Os03g07080 LOC_Os01g08200 LOC_Os02g54020 LOC_Os02g10020 LOC_Os01g23590 LOC_Os02g37000 LOC_Os03g04980 LOC_Os03g17790 LOC_Os04g09800 LOC_Os03g57790 LOC_Os03g03150 LOC_Os02g21460 LOC_Os03g53700 LOC_Os02g55300 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g57870 LOC_Os04g46450 LOC_Os03g01100 LOC_Os03g50390 LOC_Os02g29464 LOC_Os01g72880 LOC_Os04g35060 LOC_Os03g15810 LOC_Os01g43030 LOC_Os02g33450 LOC_Os02g58640 LOC_Os04g48060 LOC_Os04g40940 LOC_Os03g57450 LOC_Os01g56590 LOC_Os02g49780 LOC_Os01g72790 LOC_Os03g06900 LOC_Os03g02680 LOC_Os03g05730 LOC_Os03g51550 LOC_Os04g43300 LOC_Os02g47970 LOC_Os01g36930 LOC_Os04g36700 LOC_Os02g04490 LOC_Os03g17020 LOC_Os04g48410 LOC_Os01g01689 LOC_Os04g31950 LOC_Os03g60920 LOC_Os02g53680 LOC_Os04g01970 LOC_Os04g32930 LOC_Os03g17310 LOC_Os01g63710 LOC_Os03g46770

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g56730  LOC_Os10g41520  LOC_Os08g23680  LOC_Os05g14550  LOC_Os11g04880  LOC_Os05g48030
LOC_Os08g02690  LOC_Os07g08729  LOC_Os10g32030  LOC_Os05g11980  LOC_Os04g55040  LOC_Os11g40150
LOC_Os11g04954  LOC_Os11g44910  LOC_Os04g54340  LOC_Os06g38470  LOC_Os08g01680  LOC_Os11g48090
LOC_Os09g06560  LOC_Os12g40830  LOC_Os08g05840  LOC_Os05g43610  LOC_Os10g41450  LOC_Os07g01870
LOC_Os08g39140  LOC_Os06g08790  LOC_Os10g40590  LOC_Os10g11620  LOC_Os07g07240  LOC_Os11g08330
LOC_Os04g54940  LOC_Os07g41180  LOC_Os10g34750  LOC_Os10g10730  LOC_Os06g50910  LOC_Os12g03190
LOC_Os05g45420  LOC_Os05g38810  LOC_Os07g10350  LOC_Os11g05570  LOC_Os09g26760  LOC_Os05g19270
LOC_Os07g46660  LOC_Os08g09320  LOC_Os05g08810  LOC_Os06g14190  LOC_Os07g30980  LOC_Os07g03160
LOC_Os12g04924  LOC_Os08g44770  LOC_Os07g32480  LOC_Os10g35580  LOC_Os09g27060  LOC_Os05g37390
LOC_Os06g09330  LOC_Os07g05960  LOC_Os09g24220  LOC_Os05g01020  LOC_Os07g49150  LOC_Os07g25420
LOC_Os07g06610  LOC_Os05g22260  LOC_Os08g08040  LOC_Os08g18110  LOC_Os05g46270  LOC_Os10g34580
LOC_Os06g38930  LOC_Os05g05260  LOC_Os06g08290  LOC_Os09g21770  LOC_Os06g29790  LOC_Os06g10600
LOC_Os10g37490  LOC_Os07g43360  LOC_Os10g10990  LOC_Os11g36390  LOC_Os03g13970   LOC_Os03g49480
LOC_Os03g60130   LOC_Os02g39840   LOC_Os04g35420   LOC_Os04g39040   LOC_Os01g71960   LOC_Os04g49860
LOC_Os01g48210   LOC_Os02g30800   LOC_Os01g56550   LOC_Os01g01312   LOC_Os01g57460   LOC_Os04g54340
LOC_Os01g01960   LOC_Os02g56130   LOC_Os02g55340   LOC_Os04g45930   LOC_Os02g10060   LOC_Os02g32570
LOC_Os04g51700   LOC_Os02g11830   LOC_Os04g54330   LOC_Os01g73310   LOC_Os01g56940   LOC_Os03g13850
LOC_Os04g52900   LOC_Os04g36810   LOC_Os02g45820   LOC_Os03g07080   LOC_Os01g08200   LOC_Os02g54020
LOC_Os02g10020   LOC_Os01g23590   LOC_Os02g37000   LOC_Os03g04980   LOC_Os03g17790   LOC_Os04g09800
LOC_Os03g57790   LOC_Os03g03150   LOC_Os02g21460   LOC_Os03g53700   LOC_Os02g55300   LOC_Os02g30624
LOC_Os03g57870   LOC_Os04g46450   LOC_Os03g01100   LOC_Os03g50390   LOC_Os02g29464   LOC_Os01g72880
LOC_Os04g35060   LOC_Os03g15810   LOC_Os01g43030   LOC_Os02g33450   LOC_Os02g58640   LOC_Os04g48060
LOC_Os04g40940   LOC_Os03g57450   LOC_Os01g56590   LOC_Os02g49780   LOC_Os01g72790   LOC_Os03g06900
LOC_Os03g02680   LOC_Os03g05730   LOC_Os03g51550   LOC_Os04g43300   LOC_Os02g47970   LOC_Os01g36930
LOC_Os04g36700   LOC_Os02g04490   LOC_Os03g17020   LOC_Os04g48410   LOC_Os01g01689   LOC_Os04g31950
LOC_Os03g60920   LOC_Os02g53680   LOC_Os04g01970   LOC_Os04g32930   LOC_Os03g17310   LOC_Os01g63710
LOC_Os03g46770

Database Links
UniprotKB	Q7XQR9
Ensembl	LOC_Os04g54340.1
Refseq	NP_001054012.1
EMBL	AP008210 AL606444
KEGG	osa:4337137 dosa:Os04t0635900-01