RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g01870 View Network
Names	Os07g0109500 protein (Putative 60S ribosomal protein) (cDNA clone:001-121-G03, full insert sequence) (cDNA clone:J033117G12, full insert sequence)
Function	ribosomal protein L13, putative, expressed
Attributes	Length: 207 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 23672 pI: 11.1236 Subcellular Location (predicted): Mitochondria
Gene Model	LOC_Os07g01870.1 LOC_Os07g01870.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g42950 LOC_Os12g38000 LOC_Os10g27190 LOC_Os07g10250 LOC_Os11g08330 LOC_Os10g39410 LOC_Os07g49520 LOC_Os07g46660 LOC_Os12g37720 LOC_Os08g01100 LOC_Os09g36440 LOC_Os09g31180 LOC_Os11g38949 LOC_Os12g41400 LOC_Os07g33921 LOC_Os07g33340 LOC_Os08g45040 LOC_Os11g03400 LOC_Os07g36500 LOC_Os08g02410 LOC_Os09g32976 LOC_Os08g37780 LOC_Os09g08430 LOC_Os12g07300 LOC_Os07g44620 LOC_Os09g02810 LOC_Os10g35280 LOC_Os11g16480 LOC_Os09g26340 LOC_Os09g27420 LOC_Os07g33997 LOC_Os12g02260 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g26740 LOC_Os08g45010 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g10720 LOC_Os11g34350 LOC_Os11g01420 LOC_Os09g29630 LOC_Os07g33880 LOC_Os07g33979 LOC_Os10g07994 LOC_Os07g07709 LOC_Os12g03960 LOC_Os12g42370 LOC_Os08g02400 LOC_Os11g38959 LOC_Os08g23710 LOC_Os07g33330 LOC_Os07g33898 LOC_Os08g37444 LOC_Os11g04070 LOC_Os09g33500 LOC_Os07g41180 LOC_Os11g29190 LOC_Os11g11390 LOC_Os07g32430 LOC_Os09g38020 LOC_Os07g08330 LOC_Os12g03090 LOC_Os11g35360 LOC_Os09g07900 LOC_Os03g22180 LOC_Os02g50760 LOC_Os01g48210 LOC_Os02g40880 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g58810 LOC_Os03g61560 LOC_Os01g62350 LOC_Os02g33140 LOC_Os03g23970 LOC_Os06g45640 LOC_Os04g56480 LOC_Os05g37330 LOC_Os03g58050 LOC_Os04g30730 LOC_Os05g28510 LOC_Os03g40180 LOC_Os01g04730 LOC_Os04g43140 LOC_Os01g06010 LOC_Os02g18380 LOC_Os05g19370 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g23020 LOC_Os02g52940 LOC_Os05g48422 LOC_Os03g38000 LOC_Os04g42270 LOC_Os02g14059 LOC_Os04g54340 LOC_Os03g63430 LOC_Os01g52490 LOC_Os06g02510 LOC_Os03g44900 LOC_Os06g30970 LOC_Os01g61920 LOC_Os04g50990 LOC_Os04g49420 LOC_Os01g25880 LOC_Os03g18580 LOC_Os02g27760 LOC_Os03g58720 LOC_Os01g56980 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g50350 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g07850 LOC_Os02g55880 LOC_Os02g48660 LOC_Os05g32580 LOC_Os01g69110 LOC_Os03g21940 LOC_Os01g60360 LOC_Os03g22350 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g31470 LOC_Os06g48355 LOC_Os03g18570 LOC_Os01g62230 LOC_Os06g36160 LOC_Os03g52750 LOC_Os06g48350 LOC_Os03g29460 LOC_Os03g37970 LOC_Os04g43540 LOC_Os03g05980 LOC_Os01g60410 LOC_Os04g34450 LOC_Os05g37980 LOC_Os05g38520 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g01060 LOC_Os03g22880 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g59730 LOC_Os04g33750 LOC_Os03g05730 LOC_Os02g47140 LOC_Os01g64090 LOC_Os02g37870 LOC_Os05g30530 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g04260 LOC_Os05g05230 LOC_Os03g22900 LOC_Os03g10340 LOC_Os05g08360 LOC_Os04g28180 LOC_Os02g30050 LOC_Os01g54870 LOC_Os03g49710 LOC_Os02g38060 LOC_Os05g39050 LOC_Os03g02780 LOC_Os05g27940 LOC_Os01g47600 LOC_Os01g08850 LOC_Os03g60930 LOC_Os03g63730 LOC_Os04g51630 LOC_Os01g25240 LOC_Os06g09570 LOC_Os01g05970 LOC_Os03g02150 LOC_Os04g39700 LOC_Os05g38740

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g42950  LOC_Os12g38000  LOC_Os10g27190  LOC_Os07g10250  LOC_Os11g08330  LOC_Os10g39410
LOC_Os07g49520  LOC_Os07g46660  LOC_Os12g37720  LOC_Os08g01100  LOC_Os09g36440  LOC_Os09g31180
LOC_Os11g38949  LOC_Os12g41400  LOC_Os07g33921  LOC_Os07g33340  LOC_Os08g45040  LOC_Os11g03400
LOC_Os07g36500  LOC_Os08g02410  LOC_Os09g32976  LOC_Os08g37780  LOC_Os09g08430  LOC_Os12g07300
LOC_Os07g44620  LOC_Os09g02810  LOC_Os10g35280  LOC_Os11g16480  LOC_Os09g26340  LOC_Os09g27420
LOC_Os07g33997  LOC_Os12g02260  LOC_Os11g06750  LOC_Os07g26740  LOC_Os08g45010  LOC_Os10g28040
LOC_Os07g10720  LOC_Os11g34350  LOC_Os11g01420  LOC_Os09g29630  LOC_Os07g33880  LOC_Os07g33979
LOC_Os10g07994  LOC_Os07g07709  LOC_Os12g03960  LOC_Os12g42370  LOC_Os08g02400  LOC_Os11g38959
LOC_Os08g23710  LOC_Os07g33330  LOC_Os07g33898  LOC_Os08g37444  LOC_Os11g04070  LOC_Os09g33500
LOC_Os07g41180  LOC_Os11g29190  LOC_Os11g11390  LOC_Os07g32430  LOC_Os09g38020  LOC_Os07g08330
LOC_Os12g03090  LOC_Os11g35360  LOC_Os09g07900  LOC_Os03g22180   LOC_Os02g50760   LOC_Os01g48210
LOC_Os02g40880   LOC_Os02g13530   LOC_Os03g58810   LOC_Os03g61560   LOC_Os01g62350   LOC_Os02g33140
LOC_Os03g23970   LOC_Os06g45640   LOC_Os04g56480   LOC_Os05g37330   LOC_Os03g58050   LOC_Os04g30730
LOC_Os05g28510   LOC_Os03g40180   LOC_Os01g04730   LOC_Os04g43140   LOC_Os01g06010   LOC_Os02g18380
LOC_Os05g19370   LOC_Os03g25450   LOC_Os03g23020   LOC_Os02g52940   LOC_Os05g48422   LOC_Os03g38000
LOC_Os04g42270   LOC_Os02g14059   LOC_Os04g54340   LOC_Os03g63430   LOC_Os01g52490   LOC_Os06g02510
LOC_Os03g44900   LOC_Os06g30970   LOC_Os01g61920   LOC_Os04g50990   LOC_Os04g49420   LOC_Os01g25880
LOC_Os03g18580   LOC_Os02g27760   LOC_Os03g58720   LOC_Os01g56980   LOC_Os02g45940   LOC_Os03g50350
LOC_Os04g42380   LOC_Os03g07850   LOC_Os02g55880   LOC_Os02g48660   LOC_Os05g32580   LOC_Os01g69110
LOC_Os03g21940   LOC_Os01g60360   LOC_Os03g22350   LOC_Os02g28810   LOC_Os01g31470   LOC_Os06g48355
LOC_Os03g18570   LOC_Os01g62230   LOC_Os06g36160   LOC_Os03g52750   LOC_Os06g48350   LOC_Os03g29460
LOC_Os03g37970   LOC_Os04g43540   LOC_Os03g05980   LOC_Os01g60410   LOC_Os04g34450   LOC_Os05g37980
LOC_Os05g38520   LOC_Os01g67134   LOC_Os01g01060   LOC_Os03g22880   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g59730
LOC_Os04g33750   LOC_Os03g05730   LOC_Os02g47140   LOC_Os01g64090   LOC_Os02g37870   LOC_Os05g30530
LOC_Os01g10820   LOC_Os01g04260   LOC_Os05g05230   LOC_Os03g22900   LOC_Os03g10340   LOC_Os05g08360
LOC_Os04g28180   LOC_Os02g30050   LOC_Os01g54870   LOC_Os03g49710   LOC_Os02g38060   LOC_Os05g39050
LOC_Os03g02780   LOC_Os05g27940   LOC_Os01g47600   LOC_Os01g08850   LOC_Os03g60930   LOC_Os03g63730
LOC_Os04g51630   LOC_Os01g25240   LOC_Os06g09570   LOC_Os01g05970   LOC_Os03g02150   LOC_Os04g39700
LOC_Os05g38740

Database Links
UniprotKB	Q7F225
Ensembl	LOC_Os07g01870.1
Refseq	NP_001058724.1
EMBL	AP003759 AP004342 AP008213 AK063806 AK103048
KEGG	osa:4342219 dosa:Os07t0109500-01