RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os11g29190 View Network
Names	40S ribosomal protein S5, putative, expressed (Os11g0482000 protein) (cDNA clone:001-013-A08, full insert sequence) (cDNA clone:001-029-G10, full insert sequence)
Function	retrotransposon protein, putative, unclassified
Attributes	Length: 201 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 22493 pI: 10.1022 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Chloroplast
Gene Model	LOC_Os11g29190.1 LOC_Os11g29190.2 LOC_Os11g29190.3 LOC_Os11g29190.4 LOC_Os11g29190.5

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g38949 LOC_Os12g06910 LOC_Os11g29190 LOC_Os12g04010 LOC_Os12g07300 LOC_Os12g38000 LOC_Os03g13970 LOC_Os05g51500 LOC_Os07g08330 LOC_Os05g44320 LOC_Os11g11390 LOC_Os01g43020 LOC_Os03g14530 LOC_Os04g28180 LOC_Os02g28810 LOC_Os03g21020 LOC_Os03g21940 LOC_Os03g58430 LOC_Os03g59310 LOC_Os01g34200 LOC_Os03g21530 LOC_Os03g02680 LOC_Os08g41300 LOC_Os03g40180 LOC_Os10g31520 LOC_Os04g42380 LOC_Os09g38030 LOC_Os02g30630 LOC_Os03g10340 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g28400 LOC_Os07g31340 LOC_Os11g29190 LOC_Os11g26910 LOC_Os01g48960 LOC_Os03g29460 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g18580 LOC_Os10g34750 LOC_Os07g12320 LOC_Os01g04730 LOC_Os04g35090 LOC_Os03g22180 LOC_Os06g41750 LOC_Os08g36150 LOC_Os09g19734 LOC_Os01g68940 LOC_Os10g32880 LOC_Os11g19250 LOC_Os11g05562 LOC_Os07g30300 LOC_Os01g52490 LOC_Os01g51200 LOC_Os11g03400 LOC_Os02g33140 LOC_Os02g06592 LOC_Os08g09210 LOC_Os01g10820 LOC_Os10g07994 LOC_Os02g40880 LOC_Os09g31180 LOC_Os11g06750 LOC_Os03g19960 LOC_Os01g54870 LOC_Os04g30730 LOC_Os06g07580 LOC_Os10g10434 LOC_Os10g35580 LOC_Os05g41100 LOC_Os07g42950 LOC_Os01g71230 LOC_Os01g64090 LOC_Os09g38020 LOC_Os02g51150 LOC_Os08g21660 LOC_Os03g22880 LOC_Os07g33979 LOC_Os02g54700 LOC_Os01g74410 LOC_Os07g10250 LOC_Os05g42300 LOC_Os03g04590 LOC_Os09g08430 LOC_Os03g18570 LOC_Os08g02400 LOC_Os10g27190 LOC_Os02g18380 LOC_Os06g46770 LOC_Os01g54030 LOC_Os08g23710 LOC_Os02g52860 LOC_Os06g23160 LOC_Os05g37330 LOC_Os06g48350 LOC_Os04g51630 LOC_Os07g10720 LOC_Os07g01870 LOC_Os04g52960 LOC_Os11g04070 LOC_Os03g04750 LOC_Os01g67134 LOC_Os04g42270 LOC_Os03g38000 LOC_Os03g42770 LOC_Os03g58050 LOC_Os01g62350 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g59990 LOC_Os10g41960 LOC_Os01g49290 LOC_Os03g37970

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g38949  LOC_Os12g06910  LOC_Os11g29190  LOC_Os12g04010  LOC_Os12g07300  LOC_Os12g38000
LOC_Os03g13970   LOC_Os05g51500   LOC_Os07g08330   LOC_Os05g44320   LOC_Os11g11390   LOC_Os01g43020
LOC_Os03g14530   LOC_Os04g28180   LOC_Os02g28810   LOC_Os03g21020   LOC_Os03g21940   LOC_Os03g58430
LOC_Os03g59310   LOC_Os01g34200   LOC_Os03g21530   LOC_Os03g02680   LOC_Os08g41300   LOC_Os03g40180
LOC_Os10g31520   LOC_Os04g42380   LOC_Os09g38030   LOC_Os02g30630   LOC_Os03g10340   LOC_Os01g59730
LOC_Os03g23950   LOC_Os03g28400   LOC_Os07g31340   LOC_Os11g29190   LOC_Os11g26910   LOC_Os01g48960
LOC_Os03g29460   LOC_Os05g30530   LOC_Os03g18580   LOC_Os10g34750   LOC_Os07g12320   LOC_Os01g04730
LOC_Os04g35090   LOC_Os03g22180   LOC_Os06g41750   LOC_Os08g36150   LOC_Os09g19734   LOC_Os01g68940
LOC_Os10g32880   LOC_Os11g19250   LOC_Os11g05562   LOC_Os07g30300   LOC_Os01g52490   LOC_Os01g51200
LOC_Os11g03400   LOC_Os02g33140   LOC_Os02g06592   LOC_Os08g09210   LOC_Os01g10820   LOC_Os10g07994
LOC_Os02g40880   LOC_Os09g31180   LOC_Os11g06750   LOC_Os03g19960   LOC_Os01g54870   LOC_Os04g30730
LOC_Os06g07580   LOC_Os10g10434   LOC_Os10g35580   LOC_Os05g41100   LOC_Os07g42950   LOC_Os01g71230
LOC_Os01g64090   LOC_Os09g38020   LOC_Os02g51150   LOC_Os08g21660   LOC_Os03g22880   LOC_Os07g33979
LOC_Os02g54700   LOC_Os01g74410   LOC_Os07g10250   LOC_Os05g42300   LOC_Os03g04590   LOC_Os09g08430
LOC_Os03g18570   LOC_Os08g02400   LOC_Os10g27190   LOC_Os02g18380   LOC_Os06g46770   LOC_Os01g54030
LOC_Os08g23710   LOC_Os02g52860   LOC_Os06g23160   LOC_Os05g37330   LOC_Os06g48350   LOC_Os04g51630
LOC_Os07g10720   LOC_Os07g01870   LOC_Os04g52960   LOC_Os11g04070   LOC_Os03g04750   LOC_Os01g67134
LOC_Os04g42270   LOC_Os03g38000   LOC_Os03g42770   LOC_Os03g58050   LOC_Os01g62350   LOC_Os04g39700
LOC_Os03g08050   LOC_Os01g59990   LOC_Os10g41960   LOC_Os01g49290   LOC_Os03g37970

Database Links
UniprotKB	Q2R4A1
Ensembl	LOC_Os11g29190.2
Refseq	NP_001067900.1
EMBL	DP000010 AP008217 AK059558 AK103918 CM000148
KEGG	osa:4350516 dosa:Os11t0482000-01