RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g10340 View Network
Names	40S ribosomal protein S3a (CYC07 protein)
Function	40S ribosomal protein S3a, putative, expressed
Attributes	Length: 263 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 29727.6 pI: 10.4973 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os03g10340.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g29610 LOC_Os05g30940 LOC_Os09g27420 LOC_Os08g36150 LOC_Os07g10720 LOC_Os07g08330 LOC_Os11g38959 LOC_Os11g38949 LOC_Os05g27940 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g59310 LOC_Os09g04730 LOC_Os03g56460 LOC_Os04g33750 LOC_Os07g42950 LOC_Os09g08910 LOC_Os08g02410 LOC_Os05g25850 LOC_Os10g35000 LOC_Os03g29740 LOC_Os06g49140 LOC_Os07g08660 LOC_Os07g34740 LOC_Os04g30730 LOC_Os06g08770 LOC_Os04g50990 LOC_Os06g38470 LOC_Os06g36160 LOC_Os03g40110 LOC_Os03g60400 LOC_Os05g48030 LOC_Os06g07580 LOC_Os11g29190 LOC_Os08g39140 LOC_Os10g32920 LOC_Os03g51900 LOC_Os08g02400 LOC_Os04g20220 LOC_Os04g42270 LOC_Os06g05660 LOC_Os06g02510 LOC_Os06g15360 LOC_Os05g38520 LOC_Os03g14260 LOC_Os03g38000 LOC_Os09g30412 LOC_Os03g37970 LOC_Os03g47780 LOC_Os12g07720 LOC_Os03g18580 LOC_Os03g18570 LOC_Os10g32880 LOC_Os06g22650 LOC_Os03g56820 LOC_Os03g60600 LOC_Os07g36940 LOC_Os10g31520 LOC_Os03g42900 LOC_Os11g03400 LOC_Os04g33950 LOC_Os12g36950 LOC_Os05g38610 LOC_Os03g58430 LOC_Os03g21940 LOC_Os07g41180 LOC_Os04g57790 LOC_Os12g38000 LOC_Os07g06820 LOC_Os09g07900 LOC_Os07g33979 LOC_Os07g38760 LOC_Os04g42380 LOC_Os08g23120 LOC_Os11g06750 LOC_Os04g51630 LOC_Os07g34589 LOC_Os06g14510 LOC_Os08g41300 LOC_Os05g05470 LOC_Os04g43540 LOC_Os05g30530 LOC_Os04g01740 LOC_Os08g45010 LOC_Os05g05780 LOC_Os07g33880 LOC_Os11g04070 LOC_Os07g23110 LOC_Os04g39700 LOC_Os08g23710 LOC_Os06g07120 LOC_Os09g32532 LOC_Os10g32820 LOC_Os09g08430 LOC_Os04g46310 LOC_Os09g32976 LOC_Os07g33898 LOC_Os06g49510 LOC_Os07g01870 LOC_Os03g50885 LOC_Os06g46770 LOC_Os07g15880 LOC_Os04g52200 LOC_Os10g27190 LOC_Os07g07610 LOC_Os03g29460 LOC_Os10g42320 LOC_Os07g33921 LOC_Os08g33340 LOC_Os12g38380 LOC_Os11g11390 LOC_Os03g16020 LOC_Os07g31370 LOC_Os07g26740 LOC_Os07g12250 LOC_Os05g37330 LOC_Os07g33997 LOC_Os09g39590 LOC_Os08g31810 LOC_Os03g16110 LOC_Os05g44320 LOC_Os11g34350 LOC_Os03g16030 LOC_Os10g28040 LOC_Os03g22180 LOC_Os12g03090 LOC_Os04g40850 LOC_Os07g46660 LOC_Os05g24594 LOC_Os05g42424 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g04590 LOC_Os01g15260 LOC_Os02g18380 LOC_Os01g61820 LOC_Os03g05980 LOC_Os01g59730 LOC_Os02g12740 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g56960 LOC_Os01g66520 LOC_Os03g02970 LOC_Os02g48660 LOC_Os01g67960 LOC_Os02g47140 LOC_Os02g02960 LOC_Os02g30050 LOC_Os02g49190 LOC_Os02g08364 LOC_Os01g59990 LOC_Os02g33140 LOC_Os01g73310 LOC_Os01g56670 LOC_Os01g68940 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g54870 LOC_Os02g42690 LOC_Os02g03340 LOC_Os01g16414 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g43020 LOC_Os01g40110 LOC_Os01g62350 LOC_Os03g02150 LOC_Os02g12850 LOC_Os02g44810 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g09890 LOC_Os01g01060 LOC_Os02g56014 LOC_Os02g08300 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g61814 LOC_Os01g34200 LOC_Os01g72240 LOC_Os01g71230 LOC_Os01g67040 LOC_Os01g69920 LOC_Os01g61710 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g69110 LOC_Os03g03390 LOC_Os01g64090 LOC_Os01g72790 LOC_Os03g04750 LOC_Os02g01350 LOC_Os02g13530 LOC_Os02g06640 LOC_Os01g31470 LOC_Os02g40880

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g29610  LOC_Os05g30940  LOC_Os09g27420  LOC_Os08g36150  LOC_Os07g10720  LOC_Os07g08330
LOC_Os11g38959  LOC_Os11g38949  LOC_Os05g27940  LOC_Os04g28180  LOC_Os03g59310  LOC_Os09g04730
LOC_Os03g56460  LOC_Os04g33750  LOC_Os07g42950  LOC_Os09g08910  LOC_Os08g02410  LOC_Os05g25850
LOC_Os10g35000  LOC_Os03g29740  LOC_Os06g49140  LOC_Os07g08660  LOC_Os07g34740  LOC_Os04g30730
LOC_Os06g08770  LOC_Os04g50990  LOC_Os06g38470  LOC_Os06g36160  LOC_Os03g40110  LOC_Os03g60400
LOC_Os05g48030  LOC_Os06g07580  LOC_Os11g29190  LOC_Os08g39140  LOC_Os10g32920  LOC_Os03g51900
LOC_Os08g02400  LOC_Os04g20220  LOC_Os04g42270  LOC_Os06g05660  LOC_Os06g02510  LOC_Os06g15360
LOC_Os05g38520  LOC_Os03g14260  LOC_Os03g38000  LOC_Os09g30412  LOC_Os03g37970  LOC_Os03g47780
LOC_Os12g07720  LOC_Os03g18580  LOC_Os03g18570  LOC_Os10g32880  LOC_Os06g22650  LOC_Os03g56820
LOC_Os03g60600  LOC_Os07g36940  LOC_Os10g31520  LOC_Os03g42900  LOC_Os11g03400  LOC_Os04g33950
LOC_Os12g36950  LOC_Os05g38610  LOC_Os03g58430  LOC_Os03g21940  LOC_Os07g41180  LOC_Os04g57790
LOC_Os12g38000  LOC_Os07g06820  LOC_Os09g07900  LOC_Os07g33979  LOC_Os07g38760  LOC_Os04g42380
LOC_Os08g23120  LOC_Os11g06750  LOC_Os04g51630  LOC_Os07g34589  LOC_Os06g14510  LOC_Os08g41300
LOC_Os05g05470  LOC_Os04g43540  LOC_Os05g30530  LOC_Os04g01740  LOC_Os08g45010  LOC_Os05g05780
LOC_Os07g33880  LOC_Os11g04070  LOC_Os07g23110  LOC_Os04g39700  LOC_Os08g23710  LOC_Os06g07120
LOC_Os09g32532  LOC_Os10g32820  LOC_Os09g08430  LOC_Os04g46310  LOC_Os09g32976  LOC_Os07g33898
LOC_Os06g49510  LOC_Os07g01870  LOC_Os03g50885  LOC_Os06g46770  LOC_Os07g15880  LOC_Os04g52200
LOC_Os10g27190  LOC_Os07g07610  LOC_Os03g29460  LOC_Os10g42320  LOC_Os07g33921  LOC_Os08g33340
LOC_Os12g38380  LOC_Os11g11390  LOC_Os03g16020  LOC_Os07g31370  LOC_Os07g26740  LOC_Os07g12250
LOC_Os05g37330  LOC_Os07g33997  LOC_Os09g39590  LOC_Os08g31810  LOC_Os03g16110  LOC_Os05g44320
LOC_Os11g34350  LOC_Os03g16030  LOC_Os10g28040  LOC_Os03g22180  LOC_Os12g03090  LOC_Os04g40850
LOC_Os07g46660  LOC_Os05g24594  LOC_Os05g42424  LOC_Os02g14059   LOC_Os03g04590   LOC_Os01g15260
LOC_Os02g18380   LOC_Os01g61820   LOC_Os03g05980   LOC_Os01g59730   LOC_Os02g12740   LOC_Os01g68950
LOC_Os02g56960   LOC_Os01g66520   LOC_Os03g02970   LOC_Os02g48660   LOC_Os01g67960   LOC_Os02g47140
LOC_Os02g02960   LOC_Os02g30050   LOC_Os02g49190   LOC_Os02g08364   LOC_Os01g59990   LOC_Os02g33140
LOC_Os01g73310   LOC_Os01g56670   LOC_Os01g68940   LOC_Os01g10820   LOC_Os01g54870   LOC_Os02g42690
LOC_Os02g03340   LOC_Os01g16414   LOC_Os01g62840   LOC_Os01g43020   LOC_Os01g40110   LOC_Os01g62350
LOC_Os03g02150   LOC_Os02g12850   LOC_Os02g44810   LOC_Os02g28810   LOC_Os01g09890   LOC_Os01g01060
LOC_Os02g56014   LOC_Os02g08300   LOC_Os02g27760   LOC_Os01g61814   LOC_Os01g34200   LOC_Os01g72240
LOC_Os01g71230   LOC_Os01g67040   LOC_Os01g69920   LOC_Os01g61710   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g69110
LOC_Os03g03390   LOC_Os01g64090   LOC_Os01g72790   LOC_Os03g04750   LOC_Os02g01350   LOC_Os02g13530
LOC_Os02g06640   LOC_Os01g31470   LOC_Os02g40880

Database Links
UniprotKB	P49397
Ensembl	LOC_Os03g10340.1
Refseq	NP_001049289.1
EMBL	D26060
KEGG	osa:4331966 dosa:Os03t0200500-01