RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os11g11390 View Network
Names	60S ribosomal protein L10-1 (Protein QM) (Putative tumor suppressor SC34)
Function	retrotransposon protein, putative, Ty1-copia subclass, expressed
Attributes	Length: 225 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 25346.6 pI: 10.903 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os11g11390.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g38959 LOC_Os11g29190 LOC_Os12g38000 LOC_Os12g41400 LOC_Os12g07300 LOC_Os11g34350 LOC_Os11g24560 LOC_Os12g42370 LOC_Os12g25210 LOC_Os11g38949 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g03090 LOC_Os12g04440 LOC_Os11g48020 LOC_Os07g33979 LOC_Os09g02810 LOC_Os10g42320 LOC_Os05g32580 LOC_Os07g33898 LOC_Os01g62840 LOC_Os04g53370 LOC_Os10g27190 LOC_Os04g30730 LOC_Os08g31810 LOC_Os09g38020 LOC_Os02g30050 LOC_Os07g08330 LOC_Os01g19840 LOC_Os01g10820 LOC_Os03g59590 LOC_Os03g51900 LOC_Os07g33921 LOC_Os05g08360 LOC_Os02g48620 LOC_Os04g50990 LOC_Os05g48220 LOC_Os04g51630 LOC_Os03g02480 LOC_Os02g33140 LOC_Os07g41180 LOC_Os02g13530 LOC_Os02g30630 LOC_Os01g48960 LOC_Os09g18320 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g13110 LOC_Os03g18570 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g38000 LOC_Os06g04280 LOC_Os07g46370 LOC_Os08g21660 LOC_Os05g39050 LOC_Os07g38760 LOC_Os05g27940 LOC_Os02g01490 LOC_Os03g21940 LOC_Os01g59930 LOC_Os04g49420 LOC_Os03g22890 LOC_Os02g54340 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g10510 LOC_Os02g14059 LOC_Os02g32490 LOC_Os02g18380 LOC_Os05g38740 LOC_Os03g03430 LOC_Os01g59990 LOC_Os04g43140 LOC_Os05g48310 LOC_Os10g32920 LOC_Os05g05470 LOC_Os07g43980 LOC_Os02g47350 LOC_Os07g34740 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g10720 LOC_Os04g39700 LOC_Os04g42270 LOC_Os03g17310 LOC_Os02g06640 LOC_Os04g42380 LOC_Os06g38470 LOC_Os07g46660 LOC_Os01g10050 LOC_Os03g23020 LOC_Os03g53650 LOC_Os01g32750 LOC_Os02g40880 LOC_Os05g28750 LOC_Os07g33997 LOC_Os04g33750 LOC_Os07g12250 LOC_Os04g46310 LOC_Os01g61920 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g18860 LOC_Os08g08200 LOC_Os07g33340 LOC_Os11g04070 LOC_Os07g36500 LOC_Os02g37830 LOC_Os07g40620 LOC_Os03g42900 LOC_Os09g08430 LOC_Os06g51220 LOC_Os07g33880 LOC_Os05g42300 LOC_Os01g62350 LOC_Os03g49770 LOC_Os03g40180 LOC_Os09g26340 LOC_Os01g49350 LOC_Os02g48660 LOC_Os03g44900 LOC_Os01g54870 LOC_Os05g19370 LOC_Os08g43170 LOC_Os05g38520 LOC_Os04g43540 LOC_Os09g32976 LOC_Os06g46770 LOC_Os05g30530 LOC_Os05g48422 LOC_Os03g07080 LOC_Os01g04730 LOC_Os01g56980 LOC_Os03g22180 LOC_Os03g04590 LOC_Os03g29460 LOC_Os11g11390 LOC_Os02g28810 LOC_Os05g42424 LOC_Os06g07580 LOC_Os02g56960 LOC_Os11g03400 LOC_Os06g01980 LOC_Os01g72790 LOC_Os10g39410 LOC_Os02g56014 LOC_Os01g71230 LOC_Os03g05980 LOC_Os03g12290 LOC_Os02g25060 LOC_Os02g52860 LOC_Os10g29560 LOC_Os01g41630 LOC_Os06g36160 LOC_Os02g51150 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g07709 LOC_Os01g51010 LOC_Os08g02410 LOC_Os01g01060 LOC_Os05g37330 LOC_Os03g10340 LOC_Os01g64090 LOC_Os03g02780 LOC_Os07g49520 LOC_Os03g49210 LOC_Os07g26740 LOC_Os09g19734 LOC_Os02g01350 LOC_Os01g57930 LOC_Os02g45940 LOC_Os09g08910 LOC_Os05g51500 LOC_Os03g58050 LOC_Os03g52750 LOC_Os10g07994 LOC_Os07g01870 LOC_Os03g56820 LOC_Os01g16190 LOC_Os10g40590 LOC_Os11g01420 LOC_Os07g42950 LOC_Os03g37970 LOC_Os03g22350 LOC_Os08g02400 LOC_Os03g18580 LOC_Os07g01150 LOC_Os10g17280 LOC_Os02g47140 LOC_Os08g23710

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g38959  LOC_Os11g29190  LOC_Os12g38000  LOC_Os12g41400  LOC_Os12g07300  LOC_Os11g34350
LOC_Os11g24560  LOC_Os12g42370  LOC_Os12g25210  LOC_Os11g38949  LOC_Os11g11390  LOC_Os12g03090
LOC_Os12g04440  LOC_Os11g48020  LOC_Os07g33979   LOC_Os09g02810   LOC_Os10g42320   LOC_Os05g32580
LOC_Os07g33898   LOC_Os01g62840   LOC_Os04g53370   LOC_Os10g27190   LOC_Os04g30730   LOC_Os08g31810
LOC_Os09g38020   LOC_Os02g30050   LOC_Os07g08330   LOC_Os01g19840   LOC_Os01g10820   LOC_Os03g59590
LOC_Os03g51900   LOC_Os07g33921   LOC_Os05g08360   LOC_Os02g48620   LOC_Os04g50990   LOC_Os05g48220
LOC_Os04g51630   LOC_Os03g02480   LOC_Os02g33140   LOC_Os07g41180   LOC_Os02g13530   LOC_Os02g30630
LOC_Os01g48960   LOC_Os09g18320   LOC_Os06g02510   LOC_Os02g13110   LOC_Os03g18570   LOC_Os04g28180
LOC_Os03g38000   LOC_Os06g04280   LOC_Os07g46370   LOC_Os08g21660   LOC_Os05g39050   LOC_Os07g38760
LOC_Os05g27940   LOC_Os02g01490   LOC_Os03g21940   LOC_Os01g59930   LOC_Os04g49420   LOC_Os03g22890
LOC_Os02g54340   LOC_Os01g59730   LOC_Os03g10510   LOC_Os02g14059   LOC_Os02g32490   LOC_Os02g18380
LOC_Os05g38740   LOC_Os03g03430   LOC_Os01g59990   LOC_Os04g43140   LOC_Os05g48310   LOC_Os10g32920
LOC_Os05g05470   LOC_Os07g43980   LOC_Os02g47350   LOC_Os07g34740   LOC_Os10g28040   LOC_Os07g10720
LOC_Os04g39700   LOC_Os04g42270   LOC_Os03g17310   LOC_Os02g06640   LOC_Os04g42380   LOC_Os06g38470
LOC_Os07g46660   LOC_Os01g10050   LOC_Os03g23020   LOC_Os03g53650   LOC_Os01g32750   LOC_Os02g40880
LOC_Os05g28750   LOC_Os07g33997   LOC_Os04g33750   LOC_Os07g12250   LOC_Os04g46310   LOC_Os01g61920
LOC_Os02g27760   LOC_Os01g18860   LOC_Os08g08200   LOC_Os07g33340   LOC_Os11g04070   LOC_Os07g36500
LOC_Os02g37830   LOC_Os07g40620   LOC_Os03g42900   LOC_Os09g08430   LOC_Os06g51220   LOC_Os07g33880
LOC_Os05g42300   LOC_Os01g62350   LOC_Os03g49770   LOC_Os03g40180   LOC_Os09g26340   LOC_Os01g49350
LOC_Os02g48660   LOC_Os03g44900   LOC_Os01g54870   LOC_Os05g19370   LOC_Os08g43170   LOC_Os05g38520
LOC_Os04g43540   LOC_Os09g32976   LOC_Os06g46770   LOC_Os05g30530   LOC_Os05g48422   LOC_Os03g07080
LOC_Os01g04730   LOC_Os01g56980   LOC_Os03g22180   LOC_Os03g04590   LOC_Os03g29460   LOC_Os11g11390
LOC_Os02g28810   LOC_Os05g42424   LOC_Os06g07580   LOC_Os02g56960   LOC_Os11g03400   LOC_Os06g01980
LOC_Os01g72790   LOC_Os10g39410   LOC_Os02g56014   LOC_Os01g71230   LOC_Os03g05980   LOC_Os03g12290
LOC_Os02g25060   LOC_Os02g52860   LOC_Os10g29560   LOC_Os01g41630   LOC_Os06g36160   LOC_Os02g51150
LOC_Os11g06750   LOC_Os07g07709   LOC_Os01g51010   LOC_Os08g02410   LOC_Os01g01060   LOC_Os05g37330
LOC_Os03g10340   LOC_Os01g64090   LOC_Os03g02780   LOC_Os07g49520   LOC_Os03g49210   LOC_Os07g26740
LOC_Os09g19734   LOC_Os02g01350   LOC_Os01g57930   LOC_Os02g45940   LOC_Os09g08910   LOC_Os05g51500
LOC_Os03g58050   LOC_Os03g52750   LOC_Os10g07994   LOC_Os07g01870   LOC_Os03g56820   LOC_Os01g16190
LOC_Os10g40590   LOC_Os11g01420   LOC_Os07g42950   LOC_Os03g37970   LOC_Os03g22350   LOC_Os08g02400
LOC_Os03g18580   LOC_Os07g01150   LOC_Os10g17280   LOC_Os02g47140   LOC_Os08g23710

Database Links
UniprotKB	Q0ITS8
Ensembl	LOC_Os11g11390.1
Refseq	NP_001067524.1
EMBL	DP000010 AP008217 CM000148
KEGG	osa:4350098 dosa:Os11t0220800-01