RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os09g38020 View Network
Names	Histone H4
Function	Core component of nucleosome. Nucleosomes wrap and compact DNA into chromatin, limiting DNA accessibility to the cellular machineries which require DNA as a template. Histones thereby play a central role in transcription regulation, DNA repair, DNA replication and chromosomal stability. DNA accessibility is regulated via a complex set of post-translational modifications of histones, also called histone code, and nucleosome remodeling (By similarity).
Attributes	Length: 104 Status: Complete Existence: Inferred from homology Molecular Weight: 11409.4 pI: 12.0051 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os09g38020.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g07730 LOC_Os12g09280 LOC_Os10g34670 LOC_Os11g08330 LOC_Os12g41400 LOC_Os11g11390 LOC_Os10g41410 LOC_Os12g38380 LOC_Os11g05730 LOC_Os11g38959 LOC_Os09g38020 LOC_Os11g11070 LOC_Os10g31864 LOC_Os12g10540 LOC_Os10g35290 LOC_Os12g34510 LOC_Os10g41520 LOC_Os11g24560 LOC_Os12g39070 LOC_Os11g20384 LOC_Os12g07300 LOC_Os10g17740 LOC_Os12g35360 LOC_Os09g39420 LOC_Os12g38970 LOC_Os11g29190 LOC_Os10g17770 LOC_Os11g34305 LOC_Os10g28040 LOC_Os11g04070 LOC_Os12g31810 LOC_Os11g38949 LOC_Os11g36390 LOC_Os12g37400 LOC_Os11g29380 LOC_Os12g39210 LOC_Os12g07950 LOC_Os10g39410 LOC_Os02g47850 LOC_Os01g72790 LOC_Os05g14590 LOC_Os04g40940 LOC_Os02g58020 LOC_Os01g01312 LOC_Os01g63710 LOC_Os05g08970 LOC_Os06g05660 LOC_Os07g41180 LOC_Os05g30530 LOC_Os04g25550 LOC_Os07g23740 LOC_Os03g26440 LOC_Os05g10770 LOC_Os02g04050 LOC_Os02g04660 LOC_Os08g18150 LOC_Os07g34520 LOC_Os04g36700 LOC_Os03g08640 LOC_Os05g36280 LOC_Os03g57340 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g04490 LOC_Os01g13190 LOC_Os01g69110 LOC_Os01g67134 LOC_Os04g31950 LOC_Os07g22220 LOC_Os01g18860 LOC_Os01g51200 LOC_Os01g64640 LOC_Os05g38740 LOC_Os01g71960 LOC_Os04g31320 LOC_Os02g02890 LOC_Os02g06890 LOC_Os03g18080 LOC_Os05g01020 LOC_Os02g49840 LOC_Os05g41100 LOC_Os09g19790 LOC_Os02g10640 LOC_Os04g52130 LOC_Os05g02400 LOC_Os02g36710 LOC_Os04g49420 LOC_Os03g61560 LOC_Os08g01100 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g21970 LOC_Os07g15880 LOC_Os02g32660 LOC_Os03g50090 LOC_Os04g38870 LOC_Os01g54870 LOC_Os01g63940 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g68940 LOC_Os09g38020 LOC_Os07g10250 LOC_Os01g05970 LOC_Os06g50910 LOC_Os05g44320 LOC_Os02g10020 LOC_Os02g15220 LOC_Os07g43360 LOC_Os05g51500 LOC_Os03g08440 LOC_Os05g39850 LOC_Os07g38760 LOC_Os06g43790 LOC_Os01g41630 LOC_Os04g35700 LOC_Os02g10060 LOC_Os01g06010 LOC_Os04g42380 LOC_Os05g01230 LOC_Os02g38980 LOC_Os06g47840 LOC_Os01g05670 LOC_Os07g25680 LOC_Os03g22180 LOC_Os01g61920 LOC_Os01g48960 LOC_Os05g30940 LOC_Os06g07978 LOC_Os08g10470 LOC_Os05g29010 LOC_Os07g49150 LOC_Os01g57110 LOC_Os04g54330 LOC_Os05g45310 LOC_Os03g31090 LOC_Os06g08480 LOC_Os05g05230 LOC_Os09g02700 LOC_Os07g32400 LOC_Os01g54030 LOC_Os04g02820 LOC_Os07g02350 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g36500 LOC_Os08g33390 LOC_Os06g08770 LOC_Os01g16190 LOC_Os04g45930 LOC_Os02g28810 LOC_Os07g25420 LOC_Os07g22534 LOC_Os04g22240 LOC_Os07g36940 LOC_Os03g10510 LOC_Os01g05420 LOC_Os09g19734 LOC_Os08g45040 LOC_Os09g17850 LOC_Os03g40180 LOC_Os02g53230 LOC_Os04g40730 LOC_Os08g44770 LOC_Os09g26340 LOC_Os01g59730 LOC_Os07g03070 LOC_Os02g56130 LOC_Os01g47600 LOC_Os01g38970 LOC_Os03g02780 LOC_Os07g42450 LOC_Os07g36130 LOC_Os07g36254 LOC_Os03g20560 LOC_Os01g36930 LOC_Os05g51700 LOC_Os06g07878 LOC_Os02g53680 LOC_Os03g18410 LOC_Os01g56980 LOC_Os01g40250 LOC_Os02g14860 LOC_Os03g53190 LOC_Os01g05010 LOC_Os06g37180 LOC_Os08g01680 LOC_Os09g12270 LOC_Os03g43890 LOC_Os04g09860 LOC_Os03g57450 LOC_Os09g19830 LOC_Os02g35100 LOC_Os09g33980 LOC_Os04g01130 LOC_Os03g38000 LOC_Os02g29464 LOC_Os06g06460 LOC_Os06g51220 LOC_Os03g46770 LOC_Os02g30624 LOC_Os04g36890 LOC_Os02g45940 LOC_Os04g30800 LOC_Os01g36390 LOC_Os02g34460 LOC_Os07g08729 LOC_Os06g04580 LOC_Os01g16146 LOC_Os01g74410 LOC_Os04g43650 LOC_Os03g05980 LOC_Os07g03160 LOC_Os09g19560 LOC_Os04g35090 LOC_Os07g08170 LOC_Os03g37970 LOC_Os06g06510 LOC_Os08g37350 LOC_Os03g13970 LOC_Os02g38080 LOC_Os03g42900 LOC_Os01g56590 LOC_Os07g43060 LOC_Os09g30360 LOC_Os05g44922 LOC_Os02g55260 LOC_Os06g38470 LOC_Os03g22900 LOC_Os03g51140 LOC_Os02g48010 LOC_Os04g28180 LOC_Os07g41090 LOC_Os06g08790 LOC_Os02g13140 LOC_Os02g01490 LOC_Os04g51630 LOC_Os05g39050 LOC_Os05g05780 LOC_Os05g46270 LOC_Os03g50390 LOC_Os01g70020 LOC_Os01g01960 LOC_Os02g04160 LOC_Os05g32180 LOC_Os05g48030 LOC_Os02g55410 LOC_Os04g26841 LOC_Os04g19990 LOC_Os02g06592 LOC_Os09g03370 LOC_Os01g23630 LOC_Os05g43610 LOC_Os01g01060 LOC_Os04g57790 LOC_Os05g41510 LOC_Os07g01870 LOC_Os07g08330 LOC_Os02g02530 LOC_Os05g19370 LOC_Os02g52920 LOC_Os09g21770 LOC_Os05g03050 LOC_Os01g05950 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g49730 LOC_Os06g02620 LOC_Os02g12850 LOC_Os03g15810 LOC_Os02g13110 LOC_Os03g45920 LOC_Os03g54780

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g07730  LOC_Os12g09280  LOC_Os10g34670  LOC_Os11g08330  LOC_Os12g41400  LOC_Os11g11390
LOC_Os10g41410  LOC_Os12g38380  LOC_Os11g05730  LOC_Os11g38959  LOC_Os09g38020  LOC_Os11g11070
LOC_Os10g31864  LOC_Os12g10540  LOC_Os10g35290  LOC_Os12g34510  LOC_Os10g41520  LOC_Os11g24560
LOC_Os12g39070  LOC_Os11g20384  LOC_Os12g07300  LOC_Os10g17740  LOC_Os12g35360  LOC_Os09g39420
LOC_Os12g38970  LOC_Os11g29190  LOC_Os10g17770  LOC_Os11g34305  LOC_Os10g28040  LOC_Os11g04070
LOC_Os12g31810  LOC_Os11g38949  LOC_Os11g36390  LOC_Os12g37400  LOC_Os11g29380  LOC_Os12g39210
LOC_Os12g07950  LOC_Os10g39410  LOC_Os02g47850   LOC_Os01g72790   LOC_Os05g14590   LOC_Os04g40940
LOC_Os02g58020   LOC_Os01g01312   LOC_Os01g63710   LOC_Os05g08970   LOC_Os06g05660   LOC_Os07g41180
LOC_Os05g30530   LOC_Os04g25550   LOC_Os07g23740   LOC_Os03g26440   LOC_Os05g10770   LOC_Os02g04050
LOC_Os02g04660   LOC_Os08g18150   LOC_Os07g34520   LOC_Os04g36700   LOC_Os03g08640   LOC_Os05g36280
LOC_Os03g57340   LOC_Os06g02510   LOC_Os02g04490   LOC_Os01g13190   LOC_Os01g69110   LOC_Os01g67134
LOC_Os04g31950   LOC_Os07g22220   LOC_Os01g18860   LOC_Os01g51200   LOC_Os01g64640   LOC_Os05g38740
LOC_Os01g71960   LOC_Os04g31320   LOC_Os02g02890   LOC_Os02g06890   LOC_Os03g18080   LOC_Os05g01020
LOC_Os02g49840   LOC_Os05g41100   LOC_Os09g19790   LOC_Os02g10640   LOC_Os04g52130   LOC_Os05g02400
LOC_Os02g36710   LOC_Os04g49420   LOC_Os03g61560   LOC_Os08g01100   LOC_Os01g68950   LOC_Os02g21970
LOC_Os07g15880   LOC_Os02g32660   LOC_Os03g50090   LOC_Os04g38870   LOC_Os01g54870   LOC_Os01g63940
LOC_Os01g62840   LOC_Os01g68940   LOC_Os09g38020   LOC_Os07g10250   LOC_Os01g05970   LOC_Os06g50910
LOC_Os05g44320   LOC_Os02g10020   LOC_Os02g15220   LOC_Os07g43360   LOC_Os05g51500   LOC_Os03g08440
LOC_Os05g39850   LOC_Os07g38760   LOC_Os06g43790   LOC_Os01g41630   LOC_Os04g35700   LOC_Os02g10060
LOC_Os01g06010   LOC_Os04g42380   LOC_Os05g01230   LOC_Os02g38980   LOC_Os06g47840   LOC_Os01g05670
LOC_Os07g25680   LOC_Os03g22180   LOC_Os01g61920   LOC_Os01g48960   LOC_Os05g30940   LOC_Os06g07978
LOC_Os08g10470   LOC_Os05g29010   LOC_Os07g49150   LOC_Os01g57110   LOC_Os04g54330   LOC_Os05g45310
LOC_Os03g31090   LOC_Os06g08480   LOC_Os05g05230   LOC_Os09g02700   LOC_Os07g32400   LOC_Os01g54030
LOC_Os04g02820   LOC_Os07g02350   LOC_Os07g36140   LOC_Os07g46660   LOC_Os07g36500   LOC_Os08g33390
LOC_Os06g08770   LOC_Os01g16190   LOC_Os04g45930   LOC_Os02g28810   LOC_Os07g25420   LOC_Os07g22534
LOC_Os04g22240   LOC_Os07g36940   LOC_Os03g10510   LOC_Os01g05420   LOC_Os09g19734   LOC_Os08g45040
LOC_Os09g17850   LOC_Os03g40180   LOC_Os02g53230   LOC_Os04g40730   LOC_Os08g44770   LOC_Os09g26340
LOC_Os01g59730   LOC_Os07g03070   LOC_Os02g56130   LOC_Os01g47600   LOC_Os01g38970   LOC_Os03g02780
LOC_Os07g42450   LOC_Os07g36130   LOC_Os07g36254   LOC_Os03g20560   LOC_Os01g36930   LOC_Os05g51700
LOC_Os06g07878   LOC_Os02g53680   LOC_Os03g18410   LOC_Os01g56980   LOC_Os01g40250   LOC_Os02g14860
LOC_Os03g53190   LOC_Os01g05010   LOC_Os06g37180   LOC_Os08g01680   LOC_Os09g12270   LOC_Os03g43890
LOC_Os04g09860   LOC_Os03g57450   LOC_Os09g19830   LOC_Os02g35100   LOC_Os09g33980   LOC_Os04g01130
LOC_Os03g38000   LOC_Os02g29464   LOC_Os06g06460   LOC_Os06g51220   LOC_Os03g46770   LOC_Os02g30624
LOC_Os04g36890   LOC_Os02g45940   LOC_Os04g30800   LOC_Os01g36390   LOC_Os02g34460   LOC_Os07g08729
LOC_Os06g04580   LOC_Os01g16146   LOC_Os01g74410   LOC_Os04g43650   LOC_Os03g05980   LOC_Os07g03160
LOC_Os09g19560   LOC_Os04g35090   LOC_Os07g08170   LOC_Os03g37970   LOC_Os06g06510   LOC_Os08g37350
LOC_Os03g13970   LOC_Os02g38080   LOC_Os03g42900   LOC_Os01g56590   LOC_Os07g43060   LOC_Os09g30360
LOC_Os05g44922   LOC_Os02g55260   LOC_Os06g38470   LOC_Os03g22900   LOC_Os03g51140   LOC_Os02g48010
LOC_Os04g28180   LOC_Os07g41090   LOC_Os06g08790   LOC_Os02g13140   LOC_Os02g01490   LOC_Os04g51630
LOC_Os05g39050   LOC_Os05g05780   LOC_Os05g46270   LOC_Os03g50390   LOC_Os01g70020   LOC_Os01g01960
LOC_Os02g04160   LOC_Os05g32180   LOC_Os05g48030   LOC_Os02g55410   LOC_Os04g26841   LOC_Os04g19990
LOC_Os02g06592   LOC_Os09g03370   LOC_Os01g23630   LOC_Os05g43610   LOC_Os01g01060   LOC_Os04g57790
LOC_Os05g41510   LOC_Os07g01870   LOC_Os07g08330   LOC_Os02g02530   LOC_Os05g19370   LOC_Os02g52920
LOC_Os09g21770   LOC_Os05g03050   LOC_Os01g05950   LOC_Os01g62230   LOC_Os03g49730   LOC_Os06g02620
LOC_Os02g12850   LOC_Os03g15810   LOC_Os02g13110   LOC_Os03g45920   LOC_Os03g54780

Database Links
UniprotKB	Q7XUC9
Ensembl	LOC_Os02g45940.1 LOC_Os03g02780.1 LOC_Os04g49420.1 LOC_Os05g38740.1 LOC_Os05g39050.1 LOC_Os07g36500.1 LOC_Os09g26340.1 LOC_Os09g38020.1 LOC_Os10g39410.1
Refseq	NP_001044729.2 NP_001047762.1 NP_001048783.1 NP_001053664.1 NP_001055769.1 NP_001055786.1 NP_001063245.1 NP_001063878.1 NP_001065179.1 NP_001175250.1
EMBL	AC073166 AC096782 AC118980 DP000086 AC108876 AC108503 AC121361 AC108500 DP000009 AP003271 AP004401 AP004071 AP004255 AP005551 AP008207 AP008208 AP008209 AP008210 AP008211 AP008211 AP008215 AP008215 AP008216 AK058686 AK058741 AK059019 AK059098 AK105816 AK119240 AK119699 AP008213 AL662987 CM000138 CM000147 CM000139 CM000140 CM000141 CM000144 CM000146 CM000142 CM000146
KEGG	osa:4347799 dosa:Os09t0553100-00