RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os06g02510 View Network
Names	60S ribosomal protein L13
Function	ribosomal protein L13, putative, expressed
Attributes	Length: 209 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 24054.1 pI: 11.6314 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os06g02510.1 LOC_Os06g02510.2 LOC_Os06g02510.3 LOC_Os06g02510.4 LOC_Os06g02510.5

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g44620 LOC_Os09g07900 LOC_Os07g33898 LOC_Os12g41400 LOC_Os09g30412 LOC_Os07g42180 LOC_Os09g08430 LOC_Os12g38000 LOC_Os11g03970 LOC_Os09g38020 LOC_Os07g41180 LOC_Os08g31810 LOC_Os09g27420 LOC_Os12g03810 LOC_Os12g36950 LOC_Os11g11390 LOC_Os06g02510 LOC_Os12g32950 LOC_Os11g29400 LOC_Os08g09210 LOC_Os07g13280 LOC_Os08g39880 LOC_Os07g01870 LOC_Os07g33921 LOC_Os08g02400 LOC_Os07g49520 LOC_Os07g38300 LOC_Os06g35814 LOC_Os12g13950 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g33340 LOC_Os08g45040 LOC_Os12g38380 LOC_Os09g31180 LOC_Os07g29320 LOC_Os07g42950 LOC_Os09g02810 LOC_Os06g48355 LOC_Os10g29560 LOC_Os06g48350 LOC_Os08g41300 LOC_Os12g03090 LOC_Os06g09570 LOC_Os10g32820 LOC_Os07g39870 LOC_Os11g28980 LOC_Os09g26340 LOC_Os07g33979 LOC_Os07g46370 LOC_Os07g07709 LOC_Os07g40930 LOC_Os07g08330 LOC_Os08g37444 LOC_Os09g38030 LOC_Os07g33880 LOC_Os11g34350 LOC_Os09g32532 LOC_Os06g41750 LOC_Os08g09690 LOC_Os07g33997 LOC_Os07g10250 LOC_Os07g26740 LOC_Os11g04070 LOC_Os10g27190 LOC_Os08g43170 LOC_Os08g02410 LOC_Os07g46660 LOC_Os09g32976 LOC_Os06g36160 LOC_Os07g10720 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g36500 LOC_Os10g39410 LOC_Os09g36440 LOC_Os10g07994 LOC_Os09g07510 LOC_Os06g30970 LOC_Os08g23710 LOC_Os11g03400 LOC_Os08g21660 LOC_Os08g08040 LOC_Os07g32430 LOC_Os07g12250 LOC_Os01g34200 LOC_Os04g43140 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g21940 LOC_Os03g23020 LOC_Os05g28750 LOC_Os02g27760 LOC_Os03g63940 LOC_Os03g22180 LOC_Os03g21530 LOC_Os03g40180 LOC_Os04g04320 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g49210 LOC_Os04g33750 LOC_Os05g48422 LOC_Os01g19840 LOC_Os03g38000 LOC_Os03g18570 LOC_Os03g23909 LOC_Os01g49290 LOC_Os05g42300 LOC_Os06g02510 LOC_Os05g48220 LOC_Os01g54870 LOC_Os03g52750 LOC_Os03g02780 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g10340 LOC_Os03g58640 LOC_Os04g31320 LOC_Os05g19370 LOC_Os04g43540 LOC_Os04g42270 LOC_Os04g51630 LOC_Os01g64690 LOC_Os02g49270 LOC_Os05g51500 LOC_Os01g62350 LOC_Os02g33140 LOC_Os04g42380 LOC_Os02g40880 LOC_Os06g02144 LOC_Os06g01980 LOC_Os01g04730 LOC_Os01g15310 LOC_Os03g58050 LOC_Os01g36930 LOC_Os02g30050 LOC_Os03g50090 LOC_Os03g63730 LOC_Os04g30730 LOC_Os03g37970 LOC_Os02g48660 LOC_Os01g73310 LOC_Os01g60360 LOC_Os05g39050 LOC_Os05g13630 LOC_Os03g04750 LOC_Os02g32120 LOC_Os05g48310 LOC_Os02g56014 LOC_Os05g51700 LOC_Os03g23970 LOC_Os01g23630 LOC_Os04g31950 LOC_Os03g23950 LOC_Os02g13530 LOC_Os01g59990 LOC_Os02g01490 LOC_Os04g53370 LOC_Os03g58810 LOC_Os05g32580 LOC_Os03g48930 LOC_Os01g64090 LOC_Os03g62730 LOC_Os05g44320 LOC_Os02g52940 LOC_Os02g14059 LOC_Os04g55700 LOC_Os02g30624 LOC_Os05g08360 LOC_Os02g04050 LOC_Os01g45190 LOC_Os02g47140 LOC_Os05g38740 LOC_Os04g39700 LOC_Os04g33060 LOC_Os04g50990 LOC_Os05g38520 LOC_Os03g42900 LOC_Os02g18380 LOC_Os03g08050 LOC_Os04g28180 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g71230 LOC_Os03g29460 LOC_Os04g56480 LOC_Os02g13110 LOC_Os01g43020 LOC_Os02g37870 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g59730 LOC_Os02g03080 LOC_Os03g07080 LOC_Os05g27940 LOC_Os01g60410 LOC_Os03g36930 LOC_Os01g01060 LOC_Os05g37330 LOC_Os04g49420 LOC_Os01g62840 LOC_Os03g08020 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g18580

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g44620  LOC_Os09g07900  LOC_Os07g33898  LOC_Os12g41400  LOC_Os09g30412  LOC_Os07g42180
LOC_Os09g08430  LOC_Os12g38000  LOC_Os11g03970  LOC_Os09g38020  LOC_Os07g41180  LOC_Os08g31810
LOC_Os09g27420  LOC_Os12g03810  LOC_Os12g36950  LOC_Os11g11390  LOC_Os06g02510  LOC_Os12g32950
LOC_Os11g29400  LOC_Os08g09210  LOC_Os07g13280  LOC_Os08g39880  LOC_Os07g01870  LOC_Os07g33921
LOC_Os08g02400  LOC_Os07g49520  LOC_Os07g38300  LOC_Os06g35814  LOC_Os12g13950  LOC_Os11g06750
LOC_Os07g33340  LOC_Os08g45040  LOC_Os12g38380  LOC_Os09g31180  LOC_Os07g29320  LOC_Os07g42950
LOC_Os09g02810  LOC_Os06g48355  LOC_Os10g29560  LOC_Os06g48350  LOC_Os08g41300  LOC_Os12g03090
LOC_Os06g09570  LOC_Os10g32820  LOC_Os07g39870  LOC_Os11g28980  LOC_Os09g26340  LOC_Os07g33979
LOC_Os07g46370  LOC_Os07g07709  LOC_Os07g40930  LOC_Os07g08330  LOC_Os08g37444  LOC_Os09g38030
LOC_Os07g33880  LOC_Os11g34350  LOC_Os09g32532  LOC_Os06g41750  LOC_Os08g09690  LOC_Os07g33997
LOC_Os07g10250  LOC_Os07g26740  LOC_Os11g04070  LOC_Os10g27190  LOC_Os08g43170  LOC_Os08g02410
LOC_Os07g46660  LOC_Os09g32976  LOC_Os06g36160  LOC_Os07g10720  LOC_Os10g28040  LOC_Os07g36500
LOC_Os10g39410  LOC_Os09g36440  LOC_Os10g07994  LOC_Os09g07510  LOC_Os06g30970  LOC_Os08g23710
LOC_Os11g03400  LOC_Os08g21660  LOC_Os08g08040  LOC_Os07g32430  LOC_Os07g12250  LOC_Os01g34200
LOC_Os04g43140   LOC_Os02g45940   LOC_Os03g21940   LOC_Os03g23020   LOC_Os05g28750   LOC_Os02g27760
LOC_Os03g63940   LOC_Os03g22180   LOC_Os03g21530   LOC_Os03g40180   LOC_Os04g04320   LOC_Os03g25450
LOC_Os03g49210   LOC_Os04g33750   LOC_Os05g48422   LOC_Os01g19840   LOC_Os03g38000   LOC_Os03g18570
LOC_Os03g23909   LOC_Os01g49290   LOC_Os05g42300   LOC_Os06g02510   LOC_Os05g48220   LOC_Os01g54870
LOC_Os03g52750   LOC_Os03g02780   LOC_Os01g61920   LOC_Os03g10340   LOC_Os03g58640   LOC_Os04g31320
LOC_Os05g19370   LOC_Os04g43540   LOC_Os04g42270   LOC_Os04g51630   LOC_Os01g64690   LOC_Os02g49270
LOC_Os05g51500   LOC_Os01g62350   LOC_Os02g33140   LOC_Os04g42380   LOC_Os02g40880   LOC_Os06g02144
LOC_Os06g01980   LOC_Os01g04730   LOC_Os01g15310   LOC_Os03g58050   LOC_Os01g36930   LOC_Os02g30050
LOC_Os03g50090   LOC_Os03g63730   LOC_Os04g30730   LOC_Os03g37970   LOC_Os02g48660   LOC_Os01g73310
LOC_Os01g60360   LOC_Os05g39050   LOC_Os05g13630   LOC_Os03g04750   LOC_Os02g32120   LOC_Os05g48310
LOC_Os02g56014   LOC_Os05g51700   LOC_Os03g23970   LOC_Os01g23630   LOC_Os04g31950   LOC_Os03g23950
LOC_Os02g13530   LOC_Os01g59990   LOC_Os02g01490   LOC_Os04g53370   LOC_Os03g58810   LOC_Os05g32580
LOC_Os03g48930   LOC_Os01g64090   LOC_Os03g62730   LOC_Os05g44320   LOC_Os02g52940   LOC_Os02g14059
LOC_Os04g55700   LOC_Os02g30624   LOC_Os05g08360   LOC_Os02g04050   LOC_Os01g45190   LOC_Os02g47140
LOC_Os05g38740   LOC_Os04g39700   LOC_Os04g33060   LOC_Os04g50990   LOC_Os05g38520   LOC_Os03g42900
LOC_Os02g18380   LOC_Os03g08050   LOC_Os04g28180   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g71230   LOC_Os03g29460
LOC_Os04g56480   LOC_Os02g13110   LOC_Os01g43020   LOC_Os02g37870   LOC_Os02g28810   LOC_Os01g59730
LOC_Os02g03080   LOC_Os03g07080   LOC_Os05g27940   LOC_Os01g60410   LOC_Os03g36930   LOC_Os01g01060
LOC_Os05g37330   LOC_Os04g49420   LOC_Os01g62840   LOC_Os03g08020   LOC_Os05g30530   LOC_Os03g08010
LOC_Os03g18580

Database Links
UniprotKB	Q9LWS2
Ensembl	LOC_Os06g02510.1 LOC_Os06g02510.2 LOC_Os06g02510.3
Refseq	NP_001056613.1
EMBL	AP001389 AP002837 AP008212 AK070995 CM000143
KEGG	osa:4339923 dosa:Os06t0115500-01