RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os05g42300 View Network
Names	Os05g0502800 protein (Putative uncharacterized protein OSJNBa0017K09.13) (cDNA clone:J013020M22, full insert sequence)
Function	NAF1 domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 682 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 73147.3 pI: 4.4397 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os05g42300.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os06g47350 LOC_Os07g03690 LOC_Os08g08830 LOC_Os07g13280 LOC_Os08g39080 LOC_Os11g43640 LOC_Os12g42850 LOC_Os10g32880 LOC_Os07g08330 LOC_Os07g29320 LOC_Os08g39140 LOC_Os06g02510 LOC_Os10g26130 LOC_Os11g08330 LOC_Os06g49800 LOC_Os09g32220 LOC_Os06g07120 LOC_Os07g42632 LOC_Os07g12250 LOC_Os12g07950 LOC_Os07g07040 LOC_Os05g49760 LOC_Os08g21840 LOC_Os11g38959 LOC_Os06g23430 LOC_Os10g10990 LOC_Os12g03720 LOC_Os10g22520 LOC_Os10g27190 LOC_Os07g08660 LOC_Os10g22570 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g34570 LOC_Os08g01610 LOC_Os08g41300 LOC_Os10g41930 LOC_Os06g23440 LOC_Os09g12270 LOC_Os07g42450 LOC_Os10g40590 LOC_Os07g25440 LOC_Os06g04450 LOC_Os09g16910 LOC_Os11g11390 LOC_Os10g21344 LOC_Os11g38949 LOC_Os09g31130 LOC_Os10g30090 LOC_Os11g37080 LOC_Os09g31310 LOC_Os08g09350 LOC_Os05g42300 LOC_Os07g44190 LOC_Os08g08200 LOC_Os11g29190 LOC_Os12g06810 LOC_Os09g33986 LOC_Os05g48810 LOC_Os07g10720 LOC_Os08g28980 LOC_Os07g10350 LOC_Os07g36940 LOC_Os05g46570 LOC_Os09g20820 LOC_Os10g32820 LOC_Os09g19954 LOC_Os09g27210 LOC_Os06g44030 LOC_Os09g32532 LOC_Os09g36920 LOC_Os09g26180 LOC_Os12g05430 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g08940 LOC_Os10g29470 LOC_Os09g30412 LOC_Os07g22700 LOC_Os01g60440 LOC_Os03g18410 LOC_Os03g17020 LOC_Os05g38520 LOC_Os04g16826 LOC_Os03g59310 LOC_Os02g49610 LOC_Os02g27950 LOC_Os02g40880 LOC_Os05g41750 LOC_Os02g54340 LOC_Os01g11300 LOC_Os04g32950 LOC_Os03g38000 LOC_Os02g53680 LOC_Os02g46350 LOC_Os05g38530 LOC_Os03g50940 LOC_Os03g22740 LOC_Os02g54530 LOC_Os03g56800 LOC_Os03g18580 LOC_Os03g16860 LOC_Os03g08140 LOC_Os05g22920 LOC_Os04g52200 LOC_Os03g37970 LOC_Os03g45170 LOC_Os01g10050 LOC_Os03g05720 LOC_Os03g18210 LOC_Os03g05980 LOC_Os03g58430 LOC_Os03g64190 LOC_Os03g25450 LOC_Os04g36810 LOC_Os04g56160 LOC_Os02g48650 LOC_Os03g55270 LOC_Os05g19970 LOC_Os03g29180 LOC_Os04g25550 LOC_Os03g02830 LOC_Os04g43540 LOC_Os03g55110 LOC_Os02g33140 LOC_Os03g43590 LOC_Os03g40180 LOC_Os05g08360 LOC_Os03g01018 LOC_Os04g46190 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g27760 LOC_Os05g03430 LOC_Os01g04730 LOC_Os03g31090 LOC_Os04g52960 LOC_Os01g49290 LOC_Os04g43916 LOC_Os04g42270 LOC_Os04g51630 LOC_Os03g49770 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g50980 LOC_Os02g03540 LOC_Os03g42900 LOC_Os01g03020 LOC_Os01g16650 LOC_Os04g36620 LOC_Os02g37920 LOC_Os01g62350 LOC_Os03g08440 LOC_Os03g61560 LOC_Os05g42300 LOC_Os05g01020 LOC_Os03g04750 LOC_Os03g61100 LOC_Os04g39700 LOC_Os02g14059 LOC_Os05g27940 LOC_Os04g36890 LOC_Os01g42530 LOC_Os02g56740 LOC_Os01g67134 LOC_Os02g06890 LOC_Os02g04710 LOC_Os04g45950 LOC_Os02g47350 LOC_Os01g01960 LOC_Os01g07910 LOC_Os05g23720 LOC_Os02g40514 LOC_Os04g20220 LOC_Os03g22880 LOC_Os03g46490 LOC_Os03g15650 LOC_Os01g03144 LOC_Os01g46610 LOC_Os05g22724 LOC_Os01g01060 LOC_Os01g16520 LOC_Os05g30940 LOC_Os05g05860 LOC_Os02g57070 LOC_Os01g55700 LOC_Os05g34770 LOC_Os04g33750 LOC_Os01g59990 LOC_Os02g19770 LOC_Os01g48210 LOC_Os05g19370 LOC_Os02g03740 LOC_Os03g19960 LOC_Os04g51610 LOC_Os03g62580 LOC_Os04g40940 LOC_Os04g59494 LOC_Os01g03070 LOC_Os03g18570 LOC_Os03g01216 LOC_Os01g42480 LOC_Os04g02820

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os06g47350  LOC_Os07g03690  LOC_Os08g08830  LOC_Os07g13280  LOC_Os08g39080  LOC_Os11g43640
LOC_Os12g42850  LOC_Os10g32880  LOC_Os07g08330  LOC_Os07g29320  LOC_Os08g39140  LOC_Os06g02510
LOC_Os10g26130  LOC_Os11g08330  LOC_Os06g49800  LOC_Os09g32220  LOC_Os06g07120  LOC_Os07g42632
LOC_Os07g12250  LOC_Os12g07950  LOC_Os07g07040  LOC_Os05g49760  LOC_Os08g21840  LOC_Os11g38959
LOC_Os06g23430  LOC_Os10g10990  LOC_Os12g03720  LOC_Os10g22520  LOC_Os10g27190  LOC_Os07g08660
LOC_Os10g22570  LOC_Os11g06750  LOC_Os07g34570  LOC_Os08g01610  LOC_Os08g41300  LOC_Os10g41930
LOC_Os06g23440  LOC_Os09g12270  LOC_Os07g42450  LOC_Os10g40590  LOC_Os07g25440  LOC_Os06g04450
LOC_Os09g16910  LOC_Os11g11390  LOC_Os10g21344  LOC_Os11g38949  LOC_Os09g31130  LOC_Os10g30090
LOC_Os11g37080  LOC_Os09g31310  LOC_Os08g09350  LOC_Os05g42300  LOC_Os07g44190  LOC_Os08g08200
LOC_Os11g29190  LOC_Os12g06810  LOC_Os09g33986  LOC_Os05g48810  LOC_Os07g10720  LOC_Os08g28980
LOC_Os07g10350  LOC_Os07g36940  LOC_Os05g46570  LOC_Os09g20820  LOC_Os10g32820  LOC_Os09g19954
LOC_Os09g27210  LOC_Os06g44030  LOC_Os09g32532  LOC_Os09g36920  LOC_Os09g26180  LOC_Os12g05430
LOC_Os07g41180  LOC_Os10g08940  LOC_Os10g29470  LOC_Os09g30412  LOC_Os07g22700  LOC_Os01g60440
LOC_Os03g18410   LOC_Os03g17020   LOC_Os05g38520   LOC_Os04g16826   LOC_Os03g59310   LOC_Os02g49610
LOC_Os02g27950   LOC_Os02g40880   LOC_Os05g41750   LOC_Os02g54340   LOC_Os01g11300   LOC_Os04g32950
LOC_Os03g38000   LOC_Os02g53680   LOC_Os02g46350   LOC_Os05g38530   LOC_Os03g50940   LOC_Os03g22740
LOC_Os02g54530   LOC_Os03g56800   LOC_Os03g18580   LOC_Os03g16860   LOC_Os03g08140   LOC_Os05g22920
LOC_Os04g52200   LOC_Os03g37970   LOC_Os03g45170   LOC_Os01g10050   LOC_Os03g05720   LOC_Os03g18210
LOC_Os03g05980   LOC_Os03g58430   LOC_Os03g64190   LOC_Os03g25450   LOC_Os04g36810   LOC_Os04g56160
LOC_Os02g48650   LOC_Os03g55270   LOC_Os05g19970   LOC_Os03g29180   LOC_Os04g25550   LOC_Os03g02830
LOC_Os04g43540   LOC_Os03g55110   LOC_Os02g33140   LOC_Os03g43590   LOC_Os03g40180   LOC_Os05g08360
LOC_Os03g01018   LOC_Os04g46190   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g27760   LOC_Os05g03430   LOC_Os01g04730
LOC_Os03g31090   LOC_Os04g52960   LOC_Os01g49290   LOC_Os04g43916   LOC_Os04g42270   LOC_Os04g51630
LOC_Os03g49770   LOC_Os03g49210   LOC_Os03g50980   LOC_Os02g03540   LOC_Os03g42900   LOC_Os01g03020
LOC_Os01g16650   LOC_Os04g36620   LOC_Os02g37920   LOC_Os01g62350   LOC_Os03g08440   LOC_Os03g61560
LOC_Os05g42300   LOC_Os05g01020   LOC_Os03g04750   LOC_Os03g61100   LOC_Os04g39700   LOC_Os02g14059
LOC_Os05g27940   LOC_Os04g36890   LOC_Os01g42530   LOC_Os02g56740   LOC_Os01g67134   LOC_Os02g06890
LOC_Os02g04710   LOC_Os04g45950   LOC_Os02g47350   LOC_Os01g01960   LOC_Os01g07910   LOC_Os05g23720
LOC_Os02g40514   LOC_Os04g20220   LOC_Os03g22880   LOC_Os03g46490   LOC_Os03g15650   LOC_Os01g03144
LOC_Os01g46610   LOC_Os05g22724   LOC_Os01g01060   LOC_Os01g16520   LOC_Os05g30940   LOC_Os05g05860
LOC_Os02g57070   LOC_Os01g55700   LOC_Os05g34770   LOC_Os04g33750   LOC_Os01g59990   LOC_Os02g19770
LOC_Os01g48210   LOC_Os05g19370   LOC_Os02g03740   LOC_Os03g19960   LOC_Os04g51610   LOC_Os03g62580
LOC_Os04g40940   LOC_Os04g59494   LOC_Os01g03070   LOC_Os03g18570   LOC_Os03g01216   LOC_Os01g42480
LOC_Os04g02820

Database Links
UniprotKB	Q60EI5
Ensembl	LOC_Os05g42300.1
Refseq	NP_001055976.1
EMBL	AC130597 AP008211 AK065486
KEGG	osa:4339246 dosa:Os05t0502800-01