RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g39700 View Network
Names	60S ribosomal protein L6
Function	60S ribosomal protein L6, putative, expressed
Attributes	Length: 223 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 24628.7 pI: 10.8042 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os04g39700.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os09g08430 LOC_Os09g02810 LOC_Os11g03400 LOC_Os05g46570 LOC_Os06g35814 LOC_Os07g08660 LOC_Os05g51700 LOC_Os08g14580 LOC_Os07g33921 LOC_Os08g45010 LOC_Os07g33340 LOC_Os07g42950 LOC_Os11g16480 LOC_Os06g36770 LOC_Os07g49520 LOC_Os11g06750 LOC_Os08g02410 LOC_Os11g01420 LOC_Os11g37080 LOC_Os05g41060 LOC_Os06g48350 LOC_Os05g27940 LOC_Os12g38380 LOC_Os04g53770 LOC_Os06g15360 LOC_Os10g29560 LOC_Os12g07300 LOC_Os08g45040 LOC_Os07g33898 LOC_Os05g19370 LOC_Os06g36160 LOC_Os07g41180 LOC_Os07g33880 LOC_Os07g44620 LOC_Os05g30530 LOC_Os10g32820 LOC_Os10g07994 LOC_Os05g37330 LOC_Os11g38949 LOC_Os07g08330 LOC_Os07g46370 LOC_Os09g07900 LOC_Os07g10250 LOC_Os11g11390 LOC_Os06g43850 LOC_Os05g28750 LOC_Os05g28290 LOC_Os05g48310 LOC_Os04g43140 LOC_Os12g03090 LOC_Os08g32090 LOC_Os05g42424 LOC_Os08g02400 LOC_Os05g38520 LOC_Os12g31000 LOC_Os06g46770 LOC_Os06g07580 LOC_Os04g42270 LOC_Os04g46930 LOC_Os12g38000 LOC_Os08g23710 LOC_Os09g37860 LOC_Os08g08200 LOC_Os04g42380 LOC_Os12g31840 LOC_Os04g43540 LOC_Os07g26740 LOC_Os08g39140 LOC_Os07g40580 LOC_Os05g32580 LOC_Os08g41300 LOC_Os05g42300 LOC_Os07g10720 LOC_Os06g02510 LOC_Os07g33997 LOC_Os11g04070 LOC_Os07g46660 LOC_Os06g09570 LOC_Os04g51630 LOC_Os09g32532 LOC_Os08g31810 LOC_Os11g04220 LOC_Os09g32976 LOC_Os06g38470 LOC_Os07g43980 LOC_Os10g27190 LOC_Os09g31180 LOC_Os07g33979 LOC_Os11g29190 LOC_Os05g44320 LOC_Os05g23720 LOC_Os07g01870 LOC_Os04g50990 LOC_Os01g16190 LOC_Os02g57040 LOC_Os03g63590 LOC_Os02g47140 LOC_Os03g21940 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g16110 LOC_Os01g54870 LOC_Os03g29170 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g64090 LOC_Os02g40880 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g06640 LOC_Os01g01060 LOC_Os03g04590 LOC_Os02g44810 LOC_Os04g04320 LOC_Os01g10820 LOC_Os03g38000 LOC_Os01g41630 LOC_Os02g48660 LOC_Os03g22180 LOC_Os02g03100 LOC_Os01g52490 LOC_Os01g36930 LOC_Os03g21530 LOC_Os02g14059 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g57460 LOC_Os02g13640 LOC_Os03g22880 LOC_Os04g33750 LOC_Os02g40680 LOC_Os03g22350 LOC_Os01g59990 LOC_Os03g58810 LOC_Os01g04730 LOC_Os02g37000 LOC_Os03g23020 LOC_Os02g56014 LOC_Os03g40180 LOC_Os01g43020 LOC_Os01g19840 LOC_Os04g30730 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g51390 LOC_Os03g59310 LOC_Os02g30050 LOC_Os03g21020 LOC_Os03g63730 LOC_Os01g39260 LOC_Os03g10340 LOC_Os03g04750 LOC_Os01g73310 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g18570 LOC_Os03g61560 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g68940 LOC_Os01g05500 LOC_Os02g12850 LOC_Os03g23970 LOC_Os01g10050 LOC_Os03g14530 LOC_Os03g37970 LOC_Os02g18380 LOC_Os03g58430 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g60930 LOC_Os03g18580 LOC_Os03g52750 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g61820 LOC_Os01g34200 LOC_Os02g04050 LOC_Os02g33140 LOC_Os01g01120 LOC_Os02g13530 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g68950

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os09g08430  LOC_Os09g02810  LOC_Os11g03400  LOC_Os05g46570  LOC_Os06g35814  LOC_Os07g08660
LOC_Os05g51700  LOC_Os08g14580  LOC_Os07g33921  LOC_Os08g45010  LOC_Os07g33340  LOC_Os07g42950
LOC_Os11g16480  LOC_Os06g36770  LOC_Os07g49520  LOC_Os11g06750  LOC_Os08g02410  LOC_Os11g01420
LOC_Os11g37080  LOC_Os05g41060  LOC_Os06g48350  LOC_Os05g27940  LOC_Os12g38380  LOC_Os04g53770
LOC_Os06g15360  LOC_Os10g29560  LOC_Os12g07300  LOC_Os08g45040  LOC_Os07g33898  LOC_Os05g19370
LOC_Os06g36160  LOC_Os07g41180  LOC_Os07g33880  LOC_Os07g44620  LOC_Os05g30530  LOC_Os10g32820
LOC_Os10g07994  LOC_Os05g37330  LOC_Os11g38949  LOC_Os07g08330  LOC_Os07g46370  LOC_Os09g07900
LOC_Os07g10250  LOC_Os11g11390  LOC_Os06g43850  LOC_Os05g28750  LOC_Os05g28290  LOC_Os05g48310
LOC_Os04g43140  LOC_Os12g03090  LOC_Os08g32090  LOC_Os05g42424  LOC_Os08g02400  LOC_Os05g38520
LOC_Os12g31000  LOC_Os06g46770  LOC_Os06g07580  LOC_Os04g42270  LOC_Os04g46930  LOC_Os12g38000
LOC_Os08g23710  LOC_Os09g37860  LOC_Os08g08200  LOC_Os04g42380  LOC_Os12g31840  LOC_Os04g43540
LOC_Os07g26740  LOC_Os08g39140  LOC_Os07g40580  LOC_Os05g32580  LOC_Os08g41300  LOC_Os05g42300
LOC_Os07g10720  LOC_Os06g02510  LOC_Os07g33997  LOC_Os11g04070  LOC_Os07g46660  LOC_Os06g09570
LOC_Os04g51630  LOC_Os09g32532  LOC_Os08g31810  LOC_Os11g04220  LOC_Os09g32976  LOC_Os06g38470
LOC_Os07g43980  LOC_Os10g27190  LOC_Os09g31180  LOC_Os07g33979  LOC_Os11g29190  LOC_Os05g44320
LOC_Os05g23720  LOC_Os07g01870  LOC_Os04g50990  LOC_Os01g16190   LOC_Os02g57040   LOC_Os03g63590
LOC_Os02g47140   LOC_Os03g21940   LOC_Os03g23950   LOC_Os03g16110   LOC_Os01g54870   LOC_Os03g29170
LOC_Os01g67134   LOC_Os01g64090   LOC_Os02g40880   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g06640   LOC_Os01g01060
LOC_Os03g04590   LOC_Os02g44810   LOC_Os04g04320   LOC_Os01g10820   LOC_Os03g38000   LOC_Os01g41630
LOC_Os02g48660   LOC_Os03g22180   LOC_Os02g03100   LOC_Os01g52490   LOC_Os01g36930   LOC_Os03g21530
LOC_Os02g14059   LOC_Os01g62350   LOC_Os01g57460   LOC_Os02g13640   LOC_Os03g22880   LOC_Os04g33750
LOC_Os02g40680   LOC_Os03g22350   LOC_Os01g59990   LOC_Os03g58810   LOC_Os01g04730   LOC_Os02g37000
LOC_Os03g23020   LOC_Os02g56014   LOC_Os03g40180   LOC_Os01g43020   LOC_Os01g19840   LOC_Os04g30730
LOC_Os02g28810   LOC_Os01g51390   LOC_Os03g59310   LOC_Os02g30050   LOC_Os03g21020   LOC_Os03g63730
LOC_Os01g39260   LOC_Os03g10340   LOC_Os03g04750   LOC_Os01g73310   LOC_Os04g28180   LOC_Os03g18570
LOC_Os03g61560   LOC_Os02g27760   LOC_Os01g68940   LOC_Os01g05500   LOC_Os02g12850   LOC_Os03g23970
LOC_Os01g10050   LOC_Os03g14530   LOC_Os03g37970   LOC_Os02g18380   LOC_Os03g58430   LOC_Os01g59730
LOC_Os03g60930   LOC_Os03g18580   LOC_Os03g52750   LOC_Os01g15310   LOC_Os01g61820   LOC_Os01g34200
LOC_Os02g04050   LOC_Os02g33140   LOC_Os01g01120   LOC_Os02g13530   LOC_Os01g62840   LOC_Os01g68950

Database Links
UniprotKB	Q7XR19
Ensembl	LOC_Os04g39700.1
Refseq	NP_001053065.2
EMBL	AP008210 AK067896 AL606447
KEGG	osa:4336140 dosa:Os04t0473400-01