RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os11g03400 View Network
Names	40S ribosomal protein S16
Function	ribosomal protein, putative, expressed
Attributes	Length: 150 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 16818.9 pI: 11.189 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Chloroplast
Gene Model	LOC_Os11g03400.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g01160 LOC_Os11g34350 LOC_Os12g38000 LOC_Os11g38949 LOC_Os12g07050 LOC_Os11g29190 LOC_Os12g03090 LOC_Os11g05562 LOC_Os11g48020 LOC_Os11g06750 LOC_Os11g48080 LOC_Os11g38959 LOC_Os11g11390 LOC_Os11g03400 LOC_Os11g04070 LOC_Os12g07300 LOC_Os12g37720 LOC_Os05g27940 LOC_Os01g61930 LOC_Os08g02410 LOC_Os04g39700 LOC_Os07g26740 LOC_Os03g18570 LOC_Os08g21660 LOC_Os07g44620 LOC_Os08g39140 LOC_Os03g64190 LOC_Os02g30050 LOC_Os01g64090 LOC_Os07g08330 LOC_Os10g41410 LOC_Os05g44320 LOC_Os04g33750 LOC_Os10g08930 LOC_Os01g69110 LOC_Os11g01154 LOC_Os01g36930 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g57040 LOC_Os02g48660 LOC_Os08g31460 LOC_Os07g16950 LOC_Os03g59310 LOC_Os07g01020 LOC_Os02g28810 LOC_Os04g43140 LOC_Os06g36160 LOC_Os07g33997 LOC_Os05g30880 LOC_Os02g52470 LOC_Os01g71300 LOC_Os01g62350 LOC_Os03g22180 LOC_Os09g31180 LOC_Os09g07900 LOC_Os04g56480 LOC_Os08g45040 LOC_Os02g56014 LOC_Os05g30530 LOC_Os02g33140 LOC_Os01g52490 LOC_Os05g39960 LOC_Os04g42380 LOC_Os07g01870 LOC_Os01g53294 LOC_Os09g36920 LOC_Os01g10820 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g27190 LOC_Os03g10340 LOC_Os04g43540 LOC_Os09g28590 LOC_Os02g34600 LOC_Os08g02400 LOC_Os01g61814 LOC_Os07g01150 LOC_Os04g24180 LOC_Os08g31810 LOC_Os02g03100 LOC_Os10g32880 LOC_Os01g59990 LOC_Os03g52750 LOC_Os07g12250 LOC_Os01g59730 LOC_Os01g04730 LOC_Os03g40180 LOC_Os01g01060 LOC_Os07g33921 LOC_Os03g04750 LOC_Os02g19860 LOC_Os03g13800 LOC_Os03g53190 LOC_Os09g02810 LOC_Os04g28180 LOC_Os04g50990 LOC_Os02g12740 LOC_Os08g41300 LOC_Os05g37390 LOC_Os07g33979 LOC_Os03g21940 LOC_Os06g07580 LOC_Os05g46330 LOC_Os09g32976 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g40880 LOC_Os10g07994 LOC_Os07g43980 LOC_Os04g42270 LOC_Os09g36440 LOC_Os09g08430 LOC_Os03g19960 LOC_Os07g42950 LOC_Os07g10720 LOC_Os07g10150 LOC_Os07g25680 LOC_Os03g49710 LOC_Os05g38520 LOC_Os08g23710 LOC_Os03g03390 LOC_Os10g32550 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g23970 LOC_Os03g16110 LOC_Os07g33880 LOC_Os01g70380 LOC_Os03g05980 LOC_Os11g03400 LOC_Os09g32532 LOC_Os01g34390 LOC_Os03g59660 LOC_Os03g03150 LOC_Os05g08360 LOC_Os01g40110 LOC_Os07g34589 LOC_Os08g45010 LOC_Os01g54870 LOC_Os03g08300 LOC_Os03g51900 LOC_Os02g27760 LOC_Os03g13970 LOC_Os02g47140 LOC_Os07g10250 LOC_Os07g33898 LOC_Os03g38000 LOC_Os03g31090 LOC_Os01g09460 LOC_Os03g29540 LOC_Os03g60600 LOC_Os03g56830 LOC_Os01g19840 LOC_Os03g44780 LOC_Os03g18580 LOC_Os07g46660 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g34200 LOC_Os03g21530 LOC_Os05g19370 LOC_Os04g35090 LOC_Os01g61820 LOC_Os03g60400 LOC_Os02g57040 LOC_Os02g02570 LOC_Os07g38420 LOC_Os01g16190 LOC_Os04g51630 LOC_Os04g30730 LOC_Os02g13990 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g18380 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g18500 LOC_Os07g08660 LOC_Os10g32820 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g64970 LOC_Os04g04320 LOC_Os05g48450 LOC_Os06g08800 LOC_Os03g58430 LOC_Os05g28750 LOC_Os05g37330 LOC_Os05g51700 LOC_Os03g14530

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g01160  LOC_Os11g34350  LOC_Os12g38000  LOC_Os11g38949  LOC_Os12g07050  LOC_Os11g29190
LOC_Os12g03090  LOC_Os11g05562  LOC_Os11g48020  LOC_Os11g06750  LOC_Os11g48080  LOC_Os11g38959
LOC_Os11g11390  LOC_Os11g03400  LOC_Os11g04070  LOC_Os12g07300  LOC_Os12g37720  LOC_Os05g27940
LOC_Os01g61930   LOC_Os08g02410   LOC_Os04g39700   LOC_Os07g26740   LOC_Os03g18570   LOC_Os08g21660
LOC_Os07g44620   LOC_Os08g39140   LOC_Os03g64190   LOC_Os02g30050   LOC_Os01g64090   LOC_Os07g08330
LOC_Os10g41410   LOC_Os05g44320   LOC_Os04g33750   LOC_Os10g08930   LOC_Os01g69110   LOC_Os11g01154
LOC_Os01g36930   LOC_Os03g23909   LOC_Os03g57040   LOC_Os02g48660   LOC_Os08g31460   LOC_Os07g16950
LOC_Os03g59310   LOC_Os07g01020   LOC_Os02g28810   LOC_Os04g43140   LOC_Os06g36160   LOC_Os07g33997
LOC_Os05g30880   LOC_Os02g52470   LOC_Os01g71300   LOC_Os01g62350   LOC_Os03g22180   LOC_Os09g31180
LOC_Os09g07900   LOC_Os04g56480   LOC_Os08g45040   LOC_Os02g56014   LOC_Os05g30530   LOC_Os02g33140
LOC_Os01g52490   LOC_Os05g39960   LOC_Os04g42380   LOC_Os07g01870   LOC_Os01g53294   LOC_Os09g36920
LOC_Os01g10820   LOC_Os07g41180   LOC_Os10g27190   LOC_Os03g10340   LOC_Os04g43540   LOC_Os09g28590
LOC_Os02g34600   LOC_Os08g02400   LOC_Os01g61814   LOC_Os07g01150   LOC_Os04g24180   LOC_Os08g31810
LOC_Os02g03100   LOC_Os10g32880   LOC_Os01g59990   LOC_Os03g52750   LOC_Os07g12250   LOC_Os01g59730
LOC_Os01g04730   LOC_Os03g40180   LOC_Os01g01060   LOC_Os07g33921   LOC_Os03g04750   LOC_Os02g19860
LOC_Os03g13800   LOC_Os03g53190   LOC_Os09g02810   LOC_Os04g28180   LOC_Os04g50990   LOC_Os02g12740
LOC_Os08g41300   LOC_Os05g37390   LOC_Os07g33979   LOC_Os03g21940   LOC_Os06g07580   LOC_Os05g46330
LOC_Os09g32976   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g40880   LOC_Os10g07994   LOC_Os07g43980   LOC_Os04g42270
LOC_Os09g36440   LOC_Os09g08430   LOC_Os03g19960   LOC_Os07g42950   LOC_Os07g10720   LOC_Os07g10150
LOC_Os07g25680   LOC_Os03g49710   LOC_Os05g38520   LOC_Os08g23710   LOC_Os03g03390   LOC_Os10g32550
LOC_Os02g14059   LOC_Os03g23970   LOC_Os03g16110   LOC_Os07g33880   LOC_Os01g70380   LOC_Os03g05980
LOC_Os11g03400   LOC_Os09g32532   LOC_Os01g34390   LOC_Os03g59660   LOC_Os03g03150   LOC_Os05g08360
LOC_Os01g40110   LOC_Os07g34589   LOC_Os08g45010   LOC_Os01g54870   LOC_Os03g08300   LOC_Os03g51900
LOC_Os02g27760   LOC_Os03g13970   LOC_Os02g47140   LOC_Os07g10250   LOC_Os07g33898   LOC_Os03g38000
LOC_Os03g31090   LOC_Os01g09460   LOC_Os03g29540   LOC_Os03g60600   LOC_Os03g56830   LOC_Os01g19840
LOC_Os03g44780   LOC_Os03g18580   LOC_Os07g46660   LOC_Os03g37970   LOC_Os01g34200   LOC_Os03g21530
LOC_Os05g19370   LOC_Os04g35090   LOC_Os01g61820   LOC_Os03g60400   LOC_Os02g57040   LOC_Os02g02570
LOC_Os07g38420   LOC_Os01g16190   LOC_Os04g51630   LOC_Os04g30730   LOC_Os02g13990   LOC_Os06g02510
LOC_Os02g18380   LOC_Os02g13530   LOC_Os03g18500   LOC_Os07g08660   LOC_Os10g32820   LOC_Os01g67134
LOC_Os01g64970   LOC_Os04g04320   LOC_Os05g48450   LOC_Os06g08800   LOC_Os03g58430   LOC_Os05g28750
LOC_Os05g37330   LOC_Os05g51700   LOC_Os03g14530

Database Links
UniprotKB	Q0IQF7
Ensembl	LOC_Os11g03400.1 LOC_Os12g03090.1
Refseq	NP_001065632.1 NP_001066039.1
EMBL	DP000010 DP000011 AP008217 AP008218 CM000148
KEGG	osa:4349653 dosa:Os11t0127900-01