RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g67134 View Network
Names	60S ribosomal protein L5-1
Function	This protein binds 5S RNA (By similarity).
Attributes	Length: 302 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 34326.7 pI: 9.4988 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os01g67134.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os06g46770 LOC_Os03g49210 LOC_Os05g08360 LOC_Os02g30630 LOC_Os03g60930 LOC_Os04g56350 LOC_Os02g32690 LOC_Os02g02530 LOC_Os05g38810 LOC_Os05g41100 LOC_Os03g05980 LOC_Os04g39700 LOC_Os10g41520 LOC_Os07g12320 LOC_Os04g01130 LOC_Os05g30530 LOC_Os02g55260 LOC_Os12g29660 LOC_Os02g49610 LOC_Os02g42040 LOC_Os03g22740 LOC_Os11g41160 LOC_Os03g61560 LOC_Os06g30320 LOC_Os05g23600 LOC_Os09g38020 LOC_Os02g37880 LOC_Os02g37870 LOC_Os02g32030 LOC_Os03g27210 LOC_Os06g43790 LOC_Os10g40360 LOC_Os05g37330 LOC_Os03g60550 LOC_Os05g19370 LOC_Os02g50760 LOC_Os09g12270 LOC_Os02g39800 LOC_Os03g42900 LOC_Os04g34984 LOC_Os04g53770 LOC_Os12g29760 LOC_Os03g31090 LOC_Os08g02400 LOC_Os05g48422 LOC_Os01g71230 LOC_Os04g59494 LOC_Os03g61640 LOC_Os04g30800 LOC_Os05g27940 LOC_Os01g74410 LOC_Os07g46660 LOC_Os12g31840 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g01540 LOC_Os05g45310 LOC_Os03g04590 LOC_Os09g26340 LOC_Os03g18580 LOC_Os02g01490 LOC_Os11g30410 LOC_Os07g38760 LOC_Os09g16330 LOC_Os08g32090 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g12850 LOC_Os08g45040 LOC_Os04g42270 LOC_Os07g10720 LOC_Os07g44620 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g02210 LOC_Os02g47140 LOC_Os05g44320 LOC_Os02g32490 LOC_Os04g28180 LOC_Os05g30940 LOC_Os05g42424 LOC_Os04g42380 LOC_Os02g28810 LOC_Os04g58830 LOC_Os04g02820 LOC_Os03g22890 LOC_Os03g02780 LOC_Os03g58720 LOC_Os08g37780 LOC_Os09g16380 LOC_Os01g68940 LOC_Os08g05850 LOC_Os12g32240 LOC_Os08g31810 LOC_Os05g02400 LOC_Os04g54330 LOC_Os02g45940 LOC_Os06g14190 LOC_Os03g44900 LOC_Os08g37350 LOC_Os08g36150 LOC_Os11g01420 LOC_Os02g06640 LOC_Os06g02144 LOC_Os03g18570 LOC_Os05g38520 LOC_Os07g12250 LOC_Os09g36920 LOC_Os11g04180 LOC_Os02g06592 LOC_Os03g63730 LOC_Os07g36940 LOC_Os03g22180 LOC_Os02g04050 LOC_Os01g68950 LOC_Os10g35280 LOC_Os12g34510 LOC_Os06g01980 LOC_Os11g34305 LOC_Os02g34950 LOC_Os11g24560 LOC_Os07g01870 LOC_Os06g09570 LOC_Os08g09350 LOC_Os07g47420 LOC_Os03g02030 LOC_Os03g64190 LOC_Os03g25450 LOC_Os09g31180 LOC_Os08g23110 LOC_Os04g36890 LOC_Os11g06750 LOC_Os04g52200 LOC_Os09g29630 LOC_Os02g48660 LOC_Os04g49420 LOC_Os02g13110 LOC_Os07g10350 LOC_Os08g44530 LOC_Os12g03090 LOC_Os03g40180 LOC_Os02g14059 LOC_Os05g48810 LOC_Os07g23169 LOC_Os02g54110 LOC_Os03g50850 LOC_Os09g37860 LOC_Os11g38949 LOC_Os04g52960 LOC_Os07g29320 LOC_Os11g29400 LOC_Os05g38740 LOC_Os02g51150 LOC_Os05g42300 LOC_Os07g47580 LOC_Os04g25360 LOC_Os10g42320 LOC_Os02g26850 LOC_Os03g48930 LOC_Os09g10720 LOC_Os07g36500 LOC_Os08g02410 LOC_Os03g09920 LOC_Os11g16480 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g73880 LOC_Os03g60400 LOC_Os03g22350 LOC_Os10g39410 LOC_Os11g38959 LOC_Os06g04600 LOC_Os06g04280 LOC_Os03g38000 LOC_Os04g50990 LOC_Os07g40930 LOC_Os03g58810 LOC_Os03g11720 LOC_Os03g50380 LOC_Os05g39050 LOC_Os03g23020 LOC_Os08g05490 LOC_Os04g40730 LOC_Os07g34740 LOC_Os01g69970 LOC_Os02g27760 LOC_Os03g22900 LOC_Os02g44810 LOC_Os11g29190 LOC_Os02g52860 LOC_Os03g13370 LOC_Os02g49270 LOC_Os04g43140 LOC_Os11g03400 LOC_Os12g38110 LOC_Os02g56960 LOC_Os12g42370 LOC_Os07g43980 LOC_Os06g45100 LOC_Os01g74180 LOC_Os09g02810 LOC_Os07g30100 LOC_Os07g46370 LOC_Os10g32920 LOC_Os01g48960 LOC_Os01g61920 LOC_Os01g27730 LOC_Os01g01060 LOC_Os01g07080 LOC_Os01g41630 LOC_Os01g06010 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g13760 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g42530 LOC_Os01g05950 LOC_Os01g64090 LOC_Os01g33030 LOC_Os01g08200 LOC_Os01g62230 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g40470 LOC_Os01g59990 LOC_Os01g61814 LOC_Os01g54870

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os06g46770  LOC_Os03g49210  LOC_Os05g08360  LOC_Os02g30630  LOC_Os03g60930  LOC_Os04g56350
LOC_Os02g32690  LOC_Os02g02530  LOC_Os05g38810  LOC_Os05g41100  LOC_Os03g05980  LOC_Os04g39700
LOC_Os10g41520  LOC_Os07g12320  LOC_Os04g01130  LOC_Os05g30530  LOC_Os02g55260  LOC_Os12g29660
LOC_Os02g49610  LOC_Os02g42040  LOC_Os03g22740  LOC_Os11g41160  LOC_Os03g61560  LOC_Os06g30320
LOC_Os05g23600  LOC_Os09g38020  LOC_Os02g37880  LOC_Os02g37870  LOC_Os02g32030  LOC_Os03g27210
LOC_Os06g43790  LOC_Os10g40360  LOC_Os05g37330  LOC_Os03g60550  LOC_Os05g19370  LOC_Os02g50760
LOC_Os09g12270  LOC_Os02g39800  LOC_Os03g42900  LOC_Os04g34984  LOC_Os04g53770  LOC_Os12g29760
LOC_Os03g31090  LOC_Os08g02400  LOC_Os05g48422  LOC_Os01g71230  LOC_Os04g59494  LOC_Os03g61640
LOC_Os04g30800  LOC_Os05g27940  LOC_Os01g74410  LOC_Os07g46660  LOC_Os12g31840  LOC_Os07g41180
LOC_Os10g01540  LOC_Os05g45310  LOC_Os03g04590  LOC_Os09g26340  LOC_Os03g18580  LOC_Os02g01490
LOC_Os11g30410  LOC_Os07g38760  LOC_Os09g16330  LOC_Os08g32090  LOC_Os03g19960  LOC_Os02g12850
LOC_Os08g45040  LOC_Os04g42270  LOC_Os07g10720  LOC_Os07g44620  LOC_Os07g36140  LOC_Os07g02210
LOC_Os02g47140  LOC_Os05g44320  LOC_Os02g32490  LOC_Os04g28180  LOC_Os05g30940  LOC_Os05g42424
LOC_Os04g42380  LOC_Os02g28810  LOC_Os04g58830  LOC_Os04g02820  LOC_Os03g22890  LOC_Os03g02780
LOC_Os03g58720  LOC_Os08g37780  LOC_Os09g16380  LOC_Os01g68940  LOC_Os08g05850  LOC_Os12g32240
LOC_Os08g31810  LOC_Os05g02400  LOC_Os04g54330  LOC_Os02g45940  LOC_Os06g14190  LOC_Os03g44900
LOC_Os08g37350  LOC_Os08g36150  LOC_Os11g01420  LOC_Os02g06640  LOC_Os06g02144  LOC_Os03g18570
LOC_Os05g38520  LOC_Os07g12250  LOC_Os09g36920  LOC_Os11g04180  LOC_Os02g06592  LOC_Os03g63730
LOC_Os07g36940  LOC_Os03g22180  LOC_Os02g04050  LOC_Os01g68950  LOC_Os10g35280  LOC_Os12g34510
LOC_Os06g01980  LOC_Os11g34305  LOC_Os02g34950  LOC_Os11g24560  LOC_Os07g01870  LOC_Os06g09570
LOC_Os08g09350  LOC_Os07g47420  LOC_Os03g02030  LOC_Os03g64190  LOC_Os03g25450  LOC_Os09g31180
LOC_Os08g23110  LOC_Os04g36890  LOC_Os11g06750  LOC_Os04g52200  LOC_Os09g29630  LOC_Os02g48660
LOC_Os04g49420  LOC_Os02g13110  LOC_Os07g10350  LOC_Os08g44530  LOC_Os12g03090  LOC_Os03g40180
LOC_Os02g14059  LOC_Os05g48810  LOC_Os07g23169  LOC_Os02g54110  LOC_Os03g50850  LOC_Os09g37860
LOC_Os11g38949  LOC_Os04g52960  LOC_Os07g29320  LOC_Os11g29400  LOC_Os05g38740  LOC_Os02g51150
LOC_Os05g42300  LOC_Os07g47580  LOC_Os04g25360  LOC_Os10g42320  LOC_Os02g26850  LOC_Os03g48930
LOC_Os09g10720  LOC_Os07g36500  LOC_Os08g02410  LOC_Os03g09920  LOC_Os11g16480  LOC_Os01g67134
LOC_Os01g73880  LOC_Os03g60400  LOC_Os03g22350  LOC_Os10g39410  LOC_Os11g38959  LOC_Os06g04600
LOC_Os06g04280  LOC_Os03g38000  LOC_Os04g50990  LOC_Os07g40930  LOC_Os03g58810  LOC_Os03g11720
LOC_Os03g50380  LOC_Os05g39050  LOC_Os03g23020  LOC_Os08g05490  LOC_Os04g40730  LOC_Os07g34740
LOC_Os01g69970  LOC_Os02g27760  LOC_Os03g22900  LOC_Os02g44810  LOC_Os11g29190  LOC_Os02g52860
LOC_Os03g13370  LOC_Os02g49270  LOC_Os04g43140  LOC_Os11g03400  LOC_Os12g38110  LOC_Os02g56960
LOC_Os12g42370  LOC_Os07g43980  LOC_Os06g45100  LOC_Os01g74180  LOC_Os09g02810  LOC_Os07g30100
LOC_Os07g46370  LOC_Os10g32920  LOC_Os01g48960   LOC_Os01g61920   LOC_Os01g27730   LOC_Os01g01060
LOC_Os01g07080   LOC_Os01g41630   LOC_Os01g06010   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g13760   LOC_Os01g10820
LOC_Os01g42530   LOC_Os01g05950   LOC_Os01g64090   LOC_Os01g33030   LOC_Os01g08200   LOC_Os01g62230
LOC_Os01g62350   LOC_Os01g05970   LOC_Os01g67134   LOC_Os01g40470   LOC_Os01g59990   LOC_Os01g61814
LOC_Os01g54870

Database Links
UniprotKB	Q0JGY1
Ensembl	LOC_Os01g67134.1
Refseq	NP_001045083.1
EMBL	AP003316 AP003349 AP008207
KEGG	osa:4325100 dosa:Os01t0896800-01