RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os05g48422 View Network
Names	Os05g0558000 protein (Putative uncharacterized protein OJ1214_E03.21) (Putative uncharacterized protein OSJNBa0001A14.3) (cDNA clone:J033074P11, full insert sequence)
Function	60S ribosomal protein-related, putative, expressed
Attributes	Length: 416 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 45583.5 pI: 10.3523 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os05g48422.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g34510 LOC_Os09g12270 LOC_Os07g22534 LOC_Os11g06750 LOC_Os08g09690 LOC_Os05g48422 LOC_Os06g02510 LOC_Os10g01540 LOC_Os07g10350 LOC_Os12g07300 LOC_Os10g32920 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g40930 LOC_Os07g01870 LOC_Os10g31864 LOC_Os07g13280 LOC_Os12g06890 LOC_Os05g51500 LOC_Os08g43540 LOC_Os07g29320 LOC_Os07g25440 LOC_Os11g04070 LOC_Os07g08330 LOC_Os09g28940 LOC_Os11g04180 LOC_Os11g01420 LOC_Os07g08660 LOC_Os07g19190 LOC_Os06g09570 LOC_Os06g01980 LOC_Os09g36710 LOC_Os07g30300 LOC_Os06g04600 LOC_Os07g47420 LOC_Os06g30320 LOC_Os07g47580 LOC_Os08g32090 LOC_Os11g11390 LOC_Os07g02350 LOC_Os09g08430 LOC_Os10g35280 LOC_Os09g02700 LOC_Os09g33986 LOC_Os09g32532 LOC_Os05g49230 LOC_Os09g02810 LOC_Os09g37860 LOC_Os07g44620 LOC_Os12g31840 LOC_Os07g10720 LOC_Os08g45040 LOC_Os12g29660 LOC_Os12g42150 LOC_Os07g36254 LOC_Os07g12320 LOC_Os07g46660 LOC_Os12g07050 LOC_Os08g31840 LOC_Os08g31810 LOC_Os06g06030 LOC_Os08g41300 LOC_Os03g49210 LOC_Os02g48660 LOC_Os04g51630 LOC_Os03g61560 LOC_Os04g36810 LOC_Os02g34600 LOC_Os04g42270 LOC_Os03g60600 LOC_Os03g22740 LOC_Os01g64970 LOC_Os03g37970 LOC_Os03g04590 LOC_Os05g48422 LOC_Os04g56350 LOC_Os02g47140 LOC_Os04g53770 LOC_Os02g54110 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g40110 LOC_Os03g22890 LOC_Os01g07080 LOC_Os02g54340 LOC_Os04g30730 LOC_Os03g63730 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g27730 LOC_Os05g30420 LOC_Os05g05860 LOC_Os01g65890 LOC_Os03g23020 LOC_Os01g10050 LOC_Os02g18380 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g33030 LOC_Os03g40110 LOC_Os03g08280 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g30050 LOC_Os05g02400 LOC_Os04g50990 LOC_Os03g16110 LOC_Os03g21530 LOC_Os02g40880 LOC_Os02g49270 LOC_Os01g54870 LOC_Os05g05220 LOC_Os02g39030 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g51140 LOC_Os05g46550 LOC_Os03g58720 LOC_Os04g58830 LOC_Os03g60930 LOC_Os02g56960 LOC_Os04g47240 LOC_Os01g33050 LOC_Os03g08020 LOC_Os02g48620 LOC_Os05g38520 LOC_Os04g43140 LOC_Os03g22880 LOC_Os01g38970 LOC_Os04g46310 LOC_Os02g12850 LOC_Os04g36890 LOC_Os04g43540 LOC_Os01g69970 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g29460 LOC_Os01g61860 LOC_Os02g55370 LOC_Os01g62350 LOC_Os05g39960 LOC_Os03g51900 LOC_Os03g58430 LOC_Os05g08360 LOC_Os01g64090 LOC_Os04g51700 LOC_Os02g37870 LOC_Os02g50760 LOC_Os03g46490 LOC_Os03g58810 LOC_Os03g22350

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g34510  LOC_Os09g12270  LOC_Os07g22534  LOC_Os11g06750  LOC_Os08g09690  LOC_Os05g48422
LOC_Os06g02510  LOC_Os10g01540  LOC_Os07g10350  LOC_Os12g07300  LOC_Os10g32920  LOC_Os07g36140
LOC_Os07g40930  LOC_Os07g01870  LOC_Os10g31864  LOC_Os07g13280  LOC_Os12g06890  LOC_Os05g51500
LOC_Os08g43540  LOC_Os07g29320  LOC_Os07g25440  LOC_Os11g04070  LOC_Os07g08330  LOC_Os09g28940
LOC_Os11g04180  LOC_Os11g01420  LOC_Os07g08660  LOC_Os07g19190  LOC_Os06g09570  LOC_Os06g01980
LOC_Os09g36710  LOC_Os07g30300  LOC_Os06g04600  LOC_Os07g47420  LOC_Os06g30320  LOC_Os07g47580
LOC_Os08g32090  LOC_Os11g11390  LOC_Os07g02350  LOC_Os09g08430  LOC_Os10g35280  LOC_Os09g02700
LOC_Os09g33986  LOC_Os09g32532  LOC_Os05g49230  LOC_Os09g02810  LOC_Os09g37860  LOC_Os07g44620
LOC_Os12g31840  LOC_Os07g10720  LOC_Os08g45040  LOC_Os12g29660  LOC_Os12g42150  LOC_Os07g36254
LOC_Os07g12320  LOC_Os07g46660  LOC_Os12g07050  LOC_Os08g31840  LOC_Os08g31810  LOC_Os06g06030
LOC_Os08g41300  LOC_Os03g49210   LOC_Os02g48660   LOC_Os04g51630   LOC_Os03g61560   LOC_Os04g36810
LOC_Os02g34600   LOC_Os04g42270   LOC_Os03g60600   LOC_Os03g22740   LOC_Os01g64970   LOC_Os03g37970
LOC_Os03g04590   LOC_Os05g48422   LOC_Os04g56350   LOC_Os02g47140   LOC_Os04g53770   LOC_Os02g54110
LOC_Os03g08050   LOC_Os01g40110   LOC_Os03g22890   LOC_Os01g07080   LOC_Os02g54340   LOC_Os04g30730
LOC_Os03g63730   LOC_Os01g67134   LOC_Os01g27730   LOC_Os05g30420   LOC_Os05g05860   LOC_Os01g65890
LOC_Os03g23020   LOC_Os01g10050   LOC_Os02g18380   LOC_Os03g25450   LOC_Os03g19960   LOC_Os02g27760
LOC_Os01g33030   LOC_Os03g40110   LOC_Os03g08280   LOC_Os03g53190   LOC_Os02g30050   LOC_Os05g02400
LOC_Os04g50990   LOC_Os03g16110   LOC_Os03g21530   LOC_Os02g40880   LOC_Os02g49270   LOC_Os01g54870
LOC_Os05g05220   LOC_Os02g39030   LOC_Os03g08010   LOC_Os03g51140   LOC_Os05g46550   LOC_Os03g58720
LOC_Os04g58830   LOC_Os03g60930   LOC_Os02g56960   LOC_Os04g47240   LOC_Os01g33050   LOC_Os03g08020
LOC_Os02g48620   LOC_Os05g38520   LOC_Os04g43140   LOC_Os03g22880   LOC_Os01g38970   LOC_Os04g46310
LOC_Os02g12850   LOC_Os04g36890   LOC_Os04g43540   LOC_Os01g69970   LOC_Os01g59730   LOC_Os03g29460
LOC_Os01g61860   LOC_Os02g55370   LOC_Os01g62350   LOC_Os05g39960   LOC_Os03g51900   LOC_Os03g58430
LOC_Os05g08360   LOC_Os01g64090   LOC_Os04g51700   LOC_Os02g37870   LOC_Os02g50760   LOC_Os03g46490
LOC_Os03g58810   LOC_Os03g22350

Database Links
UniprotKB	Q6I5Z8
Ensembl	LOC_Os05g48422.1
Refseq	NP_001056294.1
EMBL	AC104709 AC144735 AP008211 AK073857
KEGG	osa:4339582 dosa:Os05t0558000-01