RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os10g32920 View Network
Names	60S ribosomal protein L17 (60S ribosomal protein L23, putative, expressed) (Os02g0814700 protein) (Os03g0139100 protein) (Os10g0466700 protein) (cDNA clone:J013057L24, full insert sequence)
Function	ribosomal protein, putative, expressed
Attributes	Length: 141 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 15030.8 pI: 11.0859 Subcellular Location (predicted): Mitochondria
Gene Model	LOC_Os10g32920.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g39070 LOC_Os10g35280 LOC_Os10g32920 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g37720 LOC_Os11g14220 LOC_Os12g25210 LOC_Os12g09000 LOC_Os11g18170 LOC_Os12g03720 LOC_Os11g04070 LOC_Os10g11200 LOC_Os08g32090 LOC_Os02g14929 LOC_Os03g26460 LOC_Os06g09570 LOC_Os01g57460 LOC_Os03g45920 LOC_Os07g38760 LOC_Os02g56960 LOC_Os03g58590 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g49210 LOC_Os05g48422 LOC_Os01g62840 LOC_Os03g10340 LOC_Os03g26450 LOC_Os07g08330 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g38000 LOC_Os10g32920 LOC_Os03g08440 LOC_Os03g46750 LOC_Os03g56830 LOC_Os03g50390 LOC_Os02g37870 LOC_Os04g43140 LOC_Os04g16776 LOC_Os09g07900 LOC_Os03g58810 LOC_Os01g08560 LOC_Os02g44500 LOC_Os05g38530 LOC_Os03g27260 LOC_Os03g49710 LOC_Os05g05470 LOC_Os10g32550 LOC_Os01g73310 LOC_Os08g36420 LOC_Os04g38340 LOC_Os04g02820 LOC_Os03g04590 LOC_Os02g54340 LOC_Os08g37444 LOC_Os03g15560 LOC_Os02g05340 LOC_Os03g61560 LOC_Os04g38940 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g72880 LOC_Os10g31520 LOC_Os09g24404 LOC_Os01g16190 LOC_Os07g25016 LOC_Os01g01060 LOC_Os07g47420 LOC_Os01g41630 LOC_Os06g36770 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g16860 LOC_Os04g16814 LOC_Os07g41180 LOC_Os03g44780 LOC_Os07g42450 LOC_Os03g08020 LOC_Os01g36930 LOC_Os06g37180 LOC_Os02g19860 LOC_Os07g46660 LOC_Os03g63690 LOC_Os01g48960 LOC_Os08g31810 LOC_Os03g56800 LOC_Os01g12730 LOC_Os02g58020 LOC_Os01g67134

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g39070  LOC_Os10g35280  LOC_Os10g32920  LOC_Os11g11390  LOC_Os12g37720  LOC_Os11g14220
LOC_Os12g25210  LOC_Os12g09000  LOC_Os11g18170  LOC_Os12g03720  LOC_Os11g04070  LOC_Os10g11200
LOC_Os08g32090   LOC_Os02g14929   LOC_Os03g26460   LOC_Os06g09570   LOC_Os01g57460   LOC_Os03g45920
LOC_Os07g38760   LOC_Os02g56960   LOC_Os03g58590   LOC_Os03g08010   LOC_Os03g49210   LOC_Os05g48422
LOC_Os01g62840   LOC_Os03g10340   LOC_Os03g26450   LOC_Os07g08330   LOC_Os05g30530   LOC_Os03g38000
LOC_Os10g32920   LOC_Os03g08440   LOC_Os03g46750   LOC_Os03g56830   LOC_Os03g50390   LOC_Os02g37870
LOC_Os04g43140   LOC_Os04g16776   LOC_Os09g07900   LOC_Os03g58810   LOC_Os01g08560   LOC_Os02g44500
LOC_Os05g38530   LOC_Os03g27260   LOC_Os03g49710   LOC_Os05g05470   LOC_Os10g32550   LOC_Os01g73310
LOC_Os08g36420   LOC_Os04g38340   LOC_Os04g02820   LOC_Os03g04590   LOC_Os02g54340   LOC_Os08g37444
LOC_Os03g15560   LOC_Os02g05340   LOC_Os03g61560   LOC_Os04g38940   LOC_Os03g08050   LOC_Os01g72880
LOC_Os10g31520   LOC_Os09g24404   LOC_Os01g16190   LOC_Os07g25016   LOC_Os01g01060   LOC_Os07g47420
LOC_Os01g41630   LOC_Os06g36770   LOC_Os03g13970   LOC_Os03g16860   LOC_Os04g16814   LOC_Os07g41180
LOC_Os03g44780   LOC_Os07g42450   LOC_Os03g08020   LOC_Os01g36930   LOC_Os06g37180   LOC_Os02g19860
LOC_Os07g46660   LOC_Os03g63690   LOC_Os01g48960   LOC_Os08g31810   LOC_Os03g56800   LOC_Os01g12730
LOC_Os02g58020   LOC_Os01g67134

Database Links
UniprotKB	Q9AV77
Ensembl	LOC_Os02g56960.1 LOC_Os03g04590.1 LOC_Os10g32920.1
Refseq	NP_001048495.1 NP_001048912.1 NP_001064806.1
EMBL	AC022457 DP000086 DP000009 AP004120 AP008208 AP008209 AP008216 AK120324 CM000147 CM000139
KEGG	osa:4348846 dosa:Os10t0466700-01