RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os12g39070 View Network
Names	Os12g0580300 protein (TATA-binding protein 2, putative, expressed) (cDNA clone:J033112A19, full insert sequence)
Function	TATA-binding protein, putative, expressed
Attributes	Length: 264 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 29012 pI: 9.1526 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os12g39070.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g39070 LOC_Os09g26180 LOC_Os01g48720 LOC_Os02g44220 LOC_Os06g47350 LOC_Os02g54120 LOC_Os01g32750 LOC_Os09g30412 LOC_Os10g27190 LOC_Os03g44900 LOC_Os05g13630 LOC_Os04g58350 LOC_Os03g29470 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g05660 LOC_Os02g34680 LOC_Os03g07450 LOC_Os01g54870 LOC_Os09g26340 LOC_Os06g07630 LOC_Os10g25770 LOC_Os08g29500 LOC_Os05g01710 LOC_Os09g02700 LOC_Os02g36974 LOC_Os04g52130 LOC_Os10g40780 LOC_Os07g27140 LOC_Os02g49610 LOC_Os03g07080 LOC_Os10g32920 LOC_Os06g44030 LOC_Os01g50960 LOC_Os02g08300 LOC_Os06g16280 LOC_Os12g35030 LOC_Os11g16540 LOC_Os02g06640 LOC_Os03g32590 LOC_Os02g02510 LOC_Os02g56960 LOC_Os06g15360 LOC_Os02g06592 LOC_Os12g39070 LOC_Os10g41520 LOC_Os09g36440 LOC_Os09g24660 LOC_Os01g62230 LOC_Os07g41580 LOC_Os08g27850 LOC_Os09g31180 LOC_Os01g38970 LOC_Os01g47600 LOC_Os09g39490 LOC_Os02g45940 LOC_Os05g23940 LOC_Os09g21770 LOC_Os10g10990 LOC_Os01g73890 LOC_Os01g52490 LOC_Os01g68940 LOC_Os04g43140 LOC_Os05g42424 LOC_Os01g05970 LOC_Os05g22670 LOC_Os01g34430 LOC_Os07g36130 LOC_Os03g61110 LOC_Os04g25550 LOC_Os05g38740 LOC_Os02g13530 LOC_Os07g43980 LOC_Os07g43060 LOC_Os03g53960 LOC_Os03g51250 LOC_Os03g13614 LOC_Os06g51220 LOC_Os09g24440 LOC_Os02g05340 LOC_Os09g35790 LOC_Os06g36160 LOC_Os04g49420 LOC_Os08g33340 LOC_Os05g39050 LOC_Os05g05860 LOC_Os09g38020 LOC_Os10g10434 LOC_Os03g04590 LOC_Os04g20220 LOC_Os06g46770 LOC_Os05g48030 LOC_Os01g69040 LOC_Os10g28040 LOC_Os01g13460 LOC_Os03g45920 LOC_Os02g54340 LOC_Os01g68950 LOC_Os04g31320 LOC_Os02g03340 LOC_Os06g08770 LOC_Os07g22950 LOC_Os01g32800 LOC_Os07g08330 LOC_Os01g05420 LOC_Os12g34510 LOC_Os01g61920 LOC_Os02g11050 LOC_Os04g10750 LOC_Os09g08430 LOC_Os02g50830 LOC_Os07g46760 LOC_Os08g01100 LOC_Os11g34200 LOC_Os10g39410 LOC_Os06g40110 LOC_Os08g42020 LOC_Os03g63940 LOC_Os03g53190 LOC_Os01g06010 LOC_Os03g62379 LOC_Os05g33240 LOC_Os03g11570 LOC_Os11g29380 LOC_Os03g02780 LOC_Os03g60130 LOC_Os04g40940 LOC_Os02g36710 LOC_Os03g22740 LOC_Os05g05230 LOC_Os07g36140 LOC_Os06g43790 LOC_Os06g08480 LOC_Os02g15220 LOC_Os10g42430 LOC_Os07g38760 LOC_Os06g36700 LOC_Os01g63940 LOC_Os06g29400 LOC_Os03g13970 LOC_Os01g73310 LOC_Os07g40580 LOC_Os01g23630 LOC_Os12g04595 LOC_Os07g45064 LOC_Os07g08170 LOC_Os12g07730 LOC_Os08g39140 LOC_Os01g05950 LOC_Os09g02284 LOC_Os01g48810

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g39070  LOC_Os09g26180   LOC_Os01g48720   LOC_Os02g44220   LOC_Os06g47350   LOC_Os02g54120
LOC_Os01g32750   LOC_Os09g30412   LOC_Os10g27190   LOC_Os03g44900   LOC_Os05g13630   LOC_Os04g58350
LOC_Os03g29470   LOC_Os07g36500   LOC_Os06g05660   LOC_Os02g34680   LOC_Os03g07450   LOC_Os01g54870
LOC_Os09g26340   LOC_Os06g07630   LOC_Os10g25770   LOC_Os08g29500   LOC_Os05g01710   LOC_Os09g02700
LOC_Os02g36974   LOC_Os04g52130   LOC_Os10g40780   LOC_Os07g27140   LOC_Os02g49610   LOC_Os03g07080
LOC_Os10g32920   LOC_Os06g44030   LOC_Os01g50960   LOC_Os02g08300   LOC_Os06g16280   LOC_Os12g35030
LOC_Os11g16540   LOC_Os02g06640   LOC_Os03g32590   LOC_Os02g02510   LOC_Os02g56960   LOC_Os06g15360
LOC_Os02g06592   LOC_Os12g39070   LOC_Os10g41520   LOC_Os09g36440   LOC_Os09g24660   LOC_Os01g62230
LOC_Os07g41580   LOC_Os08g27850   LOC_Os09g31180   LOC_Os01g38970   LOC_Os01g47600   LOC_Os09g39490
LOC_Os02g45940   LOC_Os05g23940   LOC_Os09g21770   LOC_Os10g10990   LOC_Os01g73890   LOC_Os01g52490
LOC_Os01g68940   LOC_Os04g43140   LOC_Os05g42424   LOC_Os01g05970   LOC_Os05g22670   LOC_Os01g34430
LOC_Os07g36130   LOC_Os03g61110   LOC_Os04g25550   LOC_Os05g38740   LOC_Os02g13530   LOC_Os07g43980
LOC_Os07g43060   LOC_Os03g53960   LOC_Os03g51250   LOC_Os03g13614   LOC_Os06g51220   LOC_Os09g24440
LOC_Os02g05340   LOC_Os09g35790   LOC_Os06g36160   LOC_Os04g49420   LOC_Os08g33340   LOC_Os05g39050
LOC_Os05g05860   LOC_Os09g38020   LOC_Os10g10434   LOC_Os03g04590   LOC_Os04g20220   LOC_Os06g46770
LOC_Os05g48030   LOC_Os01g69040   LOC_Os10g28040   LOC_Os01g13460   LOC_Os03g45920   LOC_Os02g54340
LOC_Os01g68950   LOC_Os04g31320   LOC_Os02g03340   LOC_Os06g08770   LOC_Os07g22950   LOC_Os01g32800
LOC_Os07g08330   LOC_Os01g05420   LOC_Os12g34510   LOC_Os01g61920   LOC_Os02g11050   LOC_Os04g10750
LOC_Os09g08430   LOC_Os02g50830   LOC_Os07g46760   LOC_Os08g01100   LOC_Os11g34200   LOC_Os10g39410
LOC_Os06g40110   LOC_Os08g42020   LOC_Os03g63940   LOC_Os03g53190   LOC_Os01g06010   LOC_Os03g62379
LOC_Os05g33240   LOC_Os03g11570   LOC_Os11g29380   LOC_Os03g02780   LOC_Os03g60130   LOC_Os04g40940
LOC_Os02g36710   LOC_Os03g22740   LOC_Os05g05230   LOC_Os07g36140   LOC_Os06g43790   LOC_Os06g08480
LOC_Os02g15220   LOC_Os10g42430   LOC_Os07g38760   LOC_Os06g36700   LOC_Os01g63940   LOC_Os06g29400
LOC_Os03g13970   LOC_Os01g73310   LOC_Os07g40580   LOC_Os01g23630   LOC_Os12g04595   LOC_Os07g45064
LOC_Os07g08170   LOC_Os12g07730   LOC_Os08g39140   LOC_Os01g05950   LOC_Os09g02284   LOC_Os01g48810

Database Links
UniprotKB	Q2QN41
Ensembl	LOC_Os12g39070.1
Refseq	NP_001067128.1
EMBL	DP000011 AP008218 AK102871
KEGG	osa:4352633 dosa:Os12t0580300-01