RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os08g33340 View Network
Names	Os08g0430200 protein (Putative osRAD23) (cDNA clone:J013000J24, full insert sequence)
Function	RAD23 DNA repair protein, putative, expressed
Attributes	Length: 407 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 42987.2 pI: 4.0811 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Nucleus
Gene Model	LOC_Os08g33340.1 LOC_Os08g33340.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g10500 LOC_Os11g29400 LOC_Os09g39500 LOC_Os09g37000 LOC_Os10g34670 LOC_Os11g40150 LOC_Os09g27370 LOC_Os09g31130 LOC_Os08g43640 LOC_Os12g39070 LOC_Os11g04220 LOC_Os09g06560 LOC_Os10g39120 LOC_Os08g33340 LOC_Os04g36700 LOC_Os05g42424 LOC_Os05g09490 LOC_Os01g33080 LOC_Os07g49150 LOC_Os03g54790 LOC_Os01g05420 LOC_Os03g13170 LOC_Os02g38340 LOC_Os05g41210 LOC_Os03g08020 LOC_Os08g12820 LOC_Os04g51630 LOC_Os05g06770 LOC_Os02g05340 LOC_Os06g30970 LOC_Os05g06350 LOC_Os03g13970 LOC_Os07g42660 LOC_Os07g07240 LOC_Os01g16190 LOC_Os06g29080 LOC_Os02g10510 LOC_Os02g08300 LOC_Os01g16240 LOC_Os02g02570 LOC_Os08g28190 LOC_Os01g04730 LOC_Os02g21970 LOC_Os06g09170 LOC_Os02g48740 LOC_Os07g30090 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g60360 LOC_Os06g46770 LOC_Os04g40940 LOC_Os07g37650 LOC_Os08g25060 LOC_Os06g40630 LOC_Os02g58020 LOC_Os03g31400 LOC_Os04g20220 LOC_Os07g48780 LOC_Os06g02144 LOC_Os03g15810 LOC_Os05g23620 LOC_Os01g49680 LOC_Os04g09800 LOC_Os08g19830 LOC_Os03g20370 LOC_Os02g56130 LOC_Os01g01312 LOC_Os05g32720 LOC_Os03g48930 LOC_Os03g08050 LOC_Os08g08080 LOC_Os02g54340 LOC_Os04g25550 LOC_Os05g46270 LOC_Os06g38470 LOC_Os02g11050 LOC_Os02g06640 LOC_Os03g11570 LOC_Os04g58350 LOC_Os02g04160 LOC_Os03g08010 LOC_Os06g07630 LOC_Os05g01020 LOC_Os06g45070 LOC_Os07g41180 LOC_Os08g33340 LOC_Os05g05860 LOC_Os03g10340 LOC_Os03g05730 LOC_Os07g25420 LOC_Os05g11980 LOC_Os02g57220 LOC_Os02g10640 LOC_Os04g56646 LOC_Os07g43360 LOC_Os02g42230 LOC_Os05g44390 LOC_Os01g48280 LOC_Os03g46650

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g10500  LOC_Os11g29400  LOC_Os09g39500  LOC_Os09g37000  LOC_Os10g34670  LOC_Os11g40150
LOC_Os09g27370  LOC_Os09g31130  LOC_Os08g43640  LOC_Os12g39070  LOC_Os11g04220  LOC_Os09g06560
LOC_Os10g39120  LOC_Os08g33340  LOC_Os04g36700   LOC_Os05g42424   LOC_Os05g09490   LOC_Os01g33080
LOC_Os07g49150   LOC_Os03g54790   LOC_Os01g05420   LOC_Os03g13170   LOC_Os02g38340   LOC_Os05g41210
LOC_Os03g08020   LOC_Os08g12820   LOC_Os04g51630   LOC_Os05g06770   LOC_Os02g05340   LOC_Os06g30970
LOC_Os05g06350   LOC_Os03g13970   LOC_Os07g42660   LOC_Os07g07240   LOC_Os01g16190   LOC_Os06g29080
LOC_Os02g10510   LOC_Os02g08300   LOC_Os01g16240   LOC_Os02g02570   LOC_Os08g28190   LOC_Os01g04730
LOC_Os02g21970   LOC_Os06g09170   LOC_Os02g48740   LOC_Os07g30090   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g60360
LOC_Os06g46770   LOC_Os04g40940   LOC_Os07g37650   LOC_Os08g25060   LOC_Os06g40630   LOC_Os02g58020
LOC_Os03g31400   LOC_Os04g20220   LOC_Os07g48780   LOC_Os06g02144   LOC_Os03g15810   LOC_Os05g23620
LOC_Os01g49680   LOC_Os04g09800   LOC_Os08g19830   LOC_Os03g20370   LOC_Os02g56130   LOC_Os01g01312
LOC_Os05g32720   LOC_Os03g48930   LOC_Os03g08050   LOC_Os08g08080   LOC_Os02g54340   LOC_Os04g25550
LOC_Os05g46270   LOC_Os06g38470   LOC_Os02g11050   LOC_Os02g06640   LOC_Os03g11570   LOC_Os04g58350
LOC_Os02g04160   LOC_Os03g08010   LOC_Os06g07630   LOC_Os05g01020   LOC_Os06g45070   LOC_Os07g41180
LOC_Os08g33340   LOC_Os05g05860   LOC_Os03g10340   LOC_Os03g05730   LOC_Os07g25420   LOC_Os05g11980
LOC_Os02g57220   LOC_Os02g10640   LOC_Os04g56646   LOC_Os07g43360   LOC_Os02g42230   LOC_Os05g44390
LOC_Os01g48280   LOC_Os03g46650

Database Links
UniprotKB	Q6ZKC1
Ensembl	LOC_Os08g33340.1
Refseq	NP_001061854.1
EMBL	AP003881 AP008214 AK064881 CM000145
KEGG	osa:4345632 dosa:Os08t0430200-01