RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g51630 View Network
Names	Os04g0605900 protein (cDNA clone:J033044G24, full insert sequence)
Function	60S ribosomal protein L7, putative, expressed
Attributes	Length: 245 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 28361.3 pI: 10.6726 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Chloroplast
Gene Model	LOC_Os04g51630.1 LOC_Os04g51630.2 LOC_Os04g51630.3

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os08g31810 LOC_Os12g38380 LOC_Os06g36160 LOC_Os05g48422 LOC_Os05g45310 LOC_Os05g05470 LOC_Os10g39410 LOC_Os11g20384 LOC_Os06g38470 LOC_Os11g34350 LOC_Os08g45040 LOC_Os04g53370 LOC_Os04g58630 LOC_Os08g33340 LOC_Os12g07300 LOC_Os05g37330 LOC_Os09g12270 LOC_Os08g02860 LOC_Os09g36440 LOC_Os04g58830 LOC_Os05g38740 LOC_Os11g11390 LOC_Os05g02400 LOC_Os07g10350 LOC_Os07g40930 LOC_Os06g43790 LOC_Os07g12250 LOC_Os10g35280 LOC_Os07g33340 LOC_Os08g23120 LOC_Os12g38000 LOC_Os09g16380 LOC_Os09g02810 LOC_Os12g07720 LOC_Os07g49520 LOC_Os06g02510 LOC_Os06g04600 LOC_Os05g27940 LOC_Os05g32580 LOC_Os09g32976 LOC_Os08g21660 LOC_Os07g46660 LOC_Os05g44320 LOC_Os05g30530 LOC_Os07g44790 LOC_Os06g14190 LOC_Os10g27190 LOC_Os04g53770 LOC_Os11g24560 LOC_Os12g13950 LOC_Os08g43170 LOC_Os08g45010 LOC_Os12g21890 LOC_Os05g42300 LOC_Os05g19370 LOC_Os05g39050 LOC_Os12g36950 LOC_Os06g48350 LOC_Os06g30320 LOC_Os09g31180 LOC_Os04g52200 LOC_Os06g48355 LOC_Os12g35360 LOC_Os07g46370 LOC_Os07g42950 LOC_Os07g10720 LOC_Os05g38520 LOC_Os12g03090 LOC_Os05g51500 LOC_Os10g07994 LOC_Os08g23710 LOC_Os06g15360 LOC_Os09g38020 LOC_Os07g44620 LOC_Os11g29190 LOC_Os09g26340 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g01870 LOC_Os11g03400 LOC_Os06g01980 LOC_Os09g08430 LOC_Os06g09570 LOC_Os07g36500 LOC_Os07g38760 LOC_Os09g16330 LOC_Os04g20220 LOC_Os01g33030 LOC_Os02g40000 LOC_Os04g30730 LOC_Os02g44810 LOC_Os04g33750 LOC_Os03g61920 LOC_Os01g64090 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g01060 LOC_Os01g67250 LOC_Os03g36930 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g13110 LOC_Os04g43140 LOC_Os04g30800 LOC_Os03g32526 LOC_Os01g66240 LOC_Os04g50990 LOC_Os02g45940 LOC_Os02g14059 LOC_Os02g33140 LOC_Os04g49420 LOC_Os01g54870 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g41630 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g58810 LOC_Os02g40880 LOC_Os01g23630 LOC_Os02g12850 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g29460 LOC_Os01g16190 LOC_Os02g28810 LOC_Os03g38000 LOC_Os01g59990 LOC_Os01g22520 LOC_Os04g43540 LOC_Os03g18570 LOC_Os02g01490 LOC_Os03g08020 LOC_Os02g11830 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g22180 LOC_Os02g30050 LOC_Os01g45190 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g63730 LOC_Os01g43020 LOC_Os01g05670 LOC_Os02g37870 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g10340 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g71230 LOC_Os02g32690 LOC_Os03g50390 LOC_Os02g18380 LOC_Os04g32330 LOC_Os03g22350 LOC_Os01g40280 LOC_Os01g32750 LOC_Os01g04730 LOC_Os03g23020 LOC_Os03g18080 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g56980 LOC_Os02g48660 LOC_Os01g62840 LOC_Os04g31950 LOC_Os03g02480 LOC_Os02g47140 LOC_Os01g73310 LOC_Os04g36890 LOC_Os02g13530 LOC_Os01g52490 LOC_Os03g29740 LOC_Os03g61560 LOC_Os03g02780 LOC_Os01g25880 LOC_Os03g08640 LOC_Os01g73880 LOC_Os03g28400 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g52750 LOC_Os04g42270 LOC_Os02g08300 LOC_Os03g44900 LOC_Os03g62730 LOC_Os02g52860 LOC_Os03g50090 LOC_Os03g18580 LOC_Os01g59730 LOC_Os04g41960 LOC_Os03g53650 LOC_Os04g40730 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g40180 LOC_Os03g21620 LOC_Os03g56800 LOC_Os03g18550 LOC_Os01g10820

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os08g31810  LOC_Os12g38380  LOC_Os06g36160  LOC_Os05g48422  LOC_Os05g45310  LOC_Os05g05470
LOC_Os10g39410  LOC_Os11g20384  LOC_Os06g38470  LOC_Os11g34350  LOC_Os08g45040  LOC_Os04g53370
LOC_Os04g58630  LOC_Os08g33340  LOC_Os12g07300  LOC_Os05g37330  LOC_Os09g12270  LOC_Os08g02860
LOC_Os09g36440  LOC_Os04g58830  LOC_Os05g38740  LOC_Os11g11390  LOC_Os05g02400  LOC_Os07g10350
LOC_Os07g40930  LOC_Os06g43790  LOC_Os07g12250  LOC_Os10g35280  LOC_Os07g33340  LOC_Os08g23120
LOC_Os12g38000  LOC_Os09g16380  LOC_Os09g02810  LOC_Os12g07720  LOC_Os07g49520  LOC_Os06g02510
LOC_Os06g04600  LOC_Os05g27940  LOC_Os05g32580  LOC_Os09g32976  LOC_Os08g21660  LOC_Os07g46660
LOC_Os05g44320  LOC_Os05g30530  LOC_Os07g44790  LOC_Os06g14190  LOC_Os10g27190  LOC_Os04g53770
LOC_Os11g24560  LOC_Os12g13950  LOC_Os08g43170  LOC_Os08g45010  LOC_Os12g21890  LOC_Os05g42300
LOC_Os05g19370  LOC_Os05g39050  LOC_Os12g36950  LOC_Os06g48350  LOC_Os06g30320  LOC_Os09g31180
LOC_Os04g52200  LOC_Os06g48355  LOC_Os12g35360  LOC_Os07g46370  LOC_Os07g42950  LOC_Os07g10720
LOC_Os05g38520  LOC_Os12g03090  LOC_Os05g51500  LOC_Os10g07994  LOC_Os08g23710  LOC_Os06g15360
LOC_Os09g38020  LOC_Os07g44620  LOC_Os11g29190  LOC_Os09g26340  LOC_Os11g06750  LOC_Os07g01870
LOC_Os11g03400  LOC_Os06g01980  LOC_Os09g08430  LOC_Os06g09570  LOC_Os07g36500  LOC_Os07g38760
LOC_Os09g16330  LOC_Os04g20220   LOC_Os01g33030   LOC_Os02g40000   LOC_Os04g30730   LOC_Os02g44810
LOC_Os04g33750   LOC_Os03g61920   LOC_Os01g64090   LOC_Os03g37970   LOC_Os01g01060   LOC_Os01g67250
LOC_Os03g36930   LOC_Os01g68950   LOC_Os02g13110   LOC_Os04g43140   LOC_Os04g30800   LOC_Os03g32526
LOC_Os01g66240   LOC_Os04g50990   LOC_Os02g45940   LOC_Os02g14059   LOC_Os02g33140   LOC_Os04g49420
LOC_Os01g54870   LOC_Os01g62350   LOC_Os01g41630   LOC_Os03g13970   LOC_Os03g58810   LOC_Os02g40880
LOC_Os01g23630   LOC_Os02g12850   LOC_Os01g61920   LOC_Os03g29460   LOC_Os01g16190   LOC_Os02g28810
LOC_Os03g38000   LOC_Os01g59990   LOC_Os01g22520   LOC_Os04g43540   LOC_Os03g18570   LOC_Os02g01490
LOC_Os03g08020   LOC_Os02g11830   LOC_Os01g68940   LOC_Os03g49210   LOC_Os03g22180   LOC_Os02g30050
LOC_Os01g45190   LOC_Os04g42380   LOC_Os03g63730   LOC_Os01g43020   LOC_Os01g05670   LOC_Os02g37870
LOC_Os03g08010   LOC_Os03g10340   LOC_Os02g27760   LOC_Os01g71230   LOC_Os02g32690   LOC_Os03g50390
LOC_Os02g18380   LOC_Os04g32330   LOC_Os03g22350   LOC_Os01g40280   LOC_Os01g32750   LOC_Os01g04730
LOC_Os03g23020   LOC_Os03g18080   LOC_Os02g30624   LOC_Os03g08050   LOC_Os01g56980   LOC_Os02g48660
LOC_Os01g62840   LOC_Os04g31950   LOC_Os03g02480   LOC_Os02g47140   LOC_Os01g73310   LOC_Os04g36890
LOC_Os02g13530   LOC_Os01g52490   LOC_Os03g29740   LOC_Os03g61560   LOC_Os03g02780   LOC_Os01g25880
LOC_Os03g08640   LOC_Os01g73880   LOC_Os03g28400   LOC_Os04g39700   LOC_Os03g52750   LOC_Os04g42270
LOC_Os02g08300   LOC_Os03g44900   LOC_Os03g62730   LOC_Os02g52860   LOC_Os03g50090   LOC_Os03g18580
LOC_Os01g59730   LOC_Os04g41960   LOC_Os03g53650   LOC_Os04g40730   LOC_Os04g28180   LOC_Os03g40180
LOC_Os03g21620   LOC_Os03g56800   LOC_Os03g18550   LOC_Os01g10820

Database Links
UniprotKB	Q0JAC6
Ensembl	LOC_Os04g51630.1 LOC_Os04g51630.2
Refseq	NP_001053797.1
EMBL	AP008210 AK073472 CM000141
KEGG	osa:4336914 dosa:Os04t0605900-01